Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFH5

NUP35, Nucleoporin NUP53, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP35Q8NFH5 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NUP35Q8NFH5 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NUP35Q8NFH5 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NUP35Q8NFH5 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NUP35Q8NFH5 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NUP35Q8NFH5 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NUP35Q8NFH5 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NUP35Q8NFH5 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NUP35Q8NFH5 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NUP35Q8NFH5 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NUP35Q8NFH5 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NUP35Q8NFH5 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NUP35Q8NFH5 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NUP35Q8NFH5 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NUP35Q8NFH5 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NUP35Q8NFH5 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NUP35Q8NFH5 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NUP35Q8NFH5 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NUP35Q8NFH5 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NUP35Q8NFH5 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NUP35Q8NFH5 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NUP35Q8NFH5 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NUP35Q8NFH5 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NUP35Q8NFH5 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NUP35Q8NFH5 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NUP35Q8NFH5 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NUP35Q8NFH5 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NUP35Q8NFH5 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NUP35Q8NFH5 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NUP35Q8NFH5 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP35Q8NFH5 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP35Q8NFH5 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP35Q8NFH5 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP35Q8NFH5 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP35Q8NFH5 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP35Q8NFH5 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP35Q8NFH5 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP35Q8NFH5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP35Q8NFH5 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP35Q8NFH5 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP35Q8NFH5 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP35Q8NFH5 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP35Q8NFH5 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP35Q8NFH5 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP35Q8NFH5 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP35Q8NFH5 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP35Q8NFH5 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP35Q8NFH5 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUP35Q8NFH5 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP35Q8NFH5 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP35Q8NFH5 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP35Q8NFH5 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP35Q8NFH5 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP35Q8NFH5 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP35Q8NFH5 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP35Q8NFH5 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP35Q8NFH5 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP35Q8NFH5 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP35Q8NFH5 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP35Q8NFH5 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP35Q8NFH5 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP35Q8NFH5 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP35Q8NFH5 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP35Q8NFH5 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP35Q8NFH5 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP35Q8NFH5 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP35Q8NFH5 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP35Q8NFH5 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP35Q8NFH5 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP35Q8NFH5 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP35Q8NFH5 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP35Q8NFH5 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP35Q8NFH5 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP35Q8NFH5 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP35Q8NFH5 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP35Q8NFH5 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP35Q8NFH5 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP35Q8NFH5 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP35Q8NFH5 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP35Q8NFH5 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP35Q8NFH5 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP35Q8NFH5 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP35Q8NFH5 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP35Q8NFH5 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP35Q8NFH5 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP35Q8NFH5 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP35Q8NFH5 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP35Q8NFH5 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP35Q8NFH5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP35Q8NFH5 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP35Q8NFH5 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP35Q8NFH5 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP35Q8NFH5 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP35Q8NFH5 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP35Q8NFH5 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP35Q8NFH5 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP35Q8NFH5 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP35Q8NFH5 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP35Q8NFH5 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP35Q8NFH5 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms