Protein–RNA interactions for Protein: Q5VX71

SUSD4, Sushi domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD4Q5VX71 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SUSD4Q5VX71 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SUSD4Q5VX71 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SUSD4Q5VX71 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SUSD4Q5VX71 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SUSD4Q5VX71 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SUSD4Q5VX71 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SUSD4Q5VX71 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SUSD4Q5VX71 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SUSD4Q5VX71 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SUSD4Q5VX71 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SUSD4Q5VX71 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SUSD4Q5VX71 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SUSD4Q5VX71 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SUSD4Q5VX71 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SUSD4Q5VX71 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SUSD4Q5VX71 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SUSD4Q5VX71 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SUSD4Q5VX71 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SUSD4Q5VX71 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SUSD4Q5VX71 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SUSD4Q5VX71 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SUSD4Q5VX71 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SUSD4Q5VX71 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SUSD4Q5VX71 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SUSD4Q5VX71 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SUSD4Q5VX71 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SUSD4Q5VX71 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SUSD4Q5VX71 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SUSD4Q5VX71 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SUSD4Q5VX71 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SUSD4Q5VX71 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SUSD4Q5VX71 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SUSD4Q5VX71 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SUSD4Q5VX71 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SUSD4Q5VX71 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SUSD4Q5VX71 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SUSD4Q5VX71 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SUSD4Q5VX71 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SUSD4Q5VX71 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SUSD4Q5VX71 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SUSD4Q5VX71 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SUSD4Q5VX71 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SUSD4Q5VX71 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SUSD4Q5VX71 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SUSD4Q5VX71 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SUSD4Q5VX71 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SUSD4Q5VX71 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SUSD4Q5VX71 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SUSD4Q5VX71 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SUSD4Q5VX71 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SUSD4Q5VX71 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SUSD4Q5VX71 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SUSD4Q5VX71 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SUSD4Q5VX71 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SUSD4Q5VX71 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SUSD4Q5VX71 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SUSD4Q5VX71 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SUSD4Q5VX71 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SUSD4Q5VX71 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SUSD4Q5VX71 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SUSD4Q5VX71 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SUSD4Q5VX71 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SUSD4Q5VX71 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SUSD4Q5VX71 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SUSD4Q5VX71 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SUSD4Q5VX71 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SUSD4Q5VX71 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SUSD4Q5VX71 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SUSD4Q5VX71 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SUSD4Q5VX71 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SUSD4Q5VX71 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SUSD4Q5VX71 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SUSD4Q5VX71 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SUSD4Q5VX71 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SUSD4Q5VX71 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SUSD4Q5VX71 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SUSD4Q5VX71 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SUSD4Q5VX71 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SUSD4Q5VX71 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SUSD4Q5VX71 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SUSD4Q5VX71 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SUSD4Q5VX71 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SUSD4Q5VX71 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SUSD4Q5VX71 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SUSD4Q5VX71 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SUSD4Q5VX71 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SUSD4Q5VX71 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SUSD4Q5VX71 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SUSD4Q5VX71 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SUSD4Q5VX71 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SUSD4Q5VX71 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SUSD4Q5VX71 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SUSD4Q5VX71 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SUSD4Q5VX71 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SUSD4Q5VX71 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SUSD4Q5VX71 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SUSD4Q5VX71 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SUSD4Q5VX71 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SUSD4Q5VX71 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms