Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms