Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC85BQ15834 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC85BQ15834 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC85BQ15834 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC85BQ15834 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC85BQ15834 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC85BQ15834 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC85BQ15834 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC85BQ15834 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC85BQ15834 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC85BQ15834 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC85BQ15834 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC85BQ15834 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC85BQ15834 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC85BQ15834 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC85BQ15834 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC85BQ15834 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC85BQ15834 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC85BQ15834 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC85BQ15834 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC85BQ15834 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC85BQ15834 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC85BQ15834 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC85BQ15834 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC85BQ15834 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC85BQ15834 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC85BQ15834 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC85BQ15834 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC85BQ15834 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC85BQ15834 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC85BQ15834 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC85BQ15834 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC85BQ15834 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC85BQ15834 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC85BQ15834 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC85BQ15834 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC85BQ15834 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC85BQ15834 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC85BQ15834 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC85BQ15834 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC85BQ15834 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC85BQ15834 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC85BQ15834 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC85BQ15834 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC85BQ15834 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC85BQ15834 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC85BQ15834 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC85BQ15834 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC85BQ15834 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC85BQ15834 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC85BQ15834 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC85BQ15834 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC85BQ15834 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC85BQ15834 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC85BQ15834 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC85BQ15834 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC85BQ15834 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC85BQ15834 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC85BQ15834 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC85BQ15834 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC85BQ15834 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC85BQ15834 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC85BQ15834 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC85BQ15834 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC85BQ15834 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC85BQ15834 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC85BQ15834 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC85BQ15834 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC85BQ15834 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC85BQ15834 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC85BQ15834 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC85BQ15834 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC85BQ15834 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC85BQ15834 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC85BQ15834 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC85BQ15834 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC85BQ15834 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC85BQ15834 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC85BQ15834 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC85BQ15834 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC85BQ15834 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC85BQ15834 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC85BQ15834 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC85BQ15834 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC85BQ15834 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC85BQ15834 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC85BQ15834 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC85BQ15834 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC85BQ15834 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC85BQ15834 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC85BQ15834 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC85BQ15834 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC85BQ15834 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC85BQ15834 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC85BQ15834 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC85BQ15834 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC85BQ15834 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC85BQ15834 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC85BQ15834 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC85BQ15834 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
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