Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCINQ13939 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCINQ13939 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCINQ13939 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CCINQ13939 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CCINQ13939 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCINQ13939 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCINQ13939 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCINQ13939 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCINQ13939 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCINQ13939 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCINQ13939 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCINQ13939 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCINQ13939 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCINQ13939 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCINQ13939 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCINQ13939 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCINQ13939 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCINQ13939 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCINQ13939 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCINQ13939 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCINQ13939 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCINQ13939 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CCINQ13939 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCINQ13939 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCINQ13939 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCINQ13939 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCINQ13939 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCINQ13939 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCINQ13939 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCINQ13939 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCINQ13939 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCINQ13939 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCINQ13939 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCINQ13939 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCINQ13939 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCINQ13939 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCINQ13939 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCINQ13939 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCINQ13939 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCINQ13939 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCINQ13939 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCINQ13939 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCINQ13939 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCINQ13939 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCINQ13939 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CCINQ13939 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCINQ13939 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCINQ13939 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCINQ13939 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCINQ13939 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCINQ13939 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCINQ13939 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCINQ13939 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCINQ13939 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCINQ13939 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCINQ13939 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCINQ13939 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCINQ13939 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCINQ13939 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCINQ13939 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCINQ13939 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCINQ13939 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCINQ13939 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCINQ13939 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCINQ13939 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCINQ13939 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCINQ13939 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCINQ13939 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCINQ13939 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCINQ13939 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCINQ13939 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCINQ13939 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCINQ13939 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCINQ13939 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCINQ13939 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCINQ13939 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCINQ13939 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCINQ13939 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCINQ13939 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCINQ13939 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCINQ13939 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCINQ13939 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCINQ13939 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCINQ13939 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCINQ13939 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCINQ13939 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCINQ13939 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCINQ13939 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCINQ13939 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCINQ13939 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCINQ13939 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCINQ13939 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCINQ13939 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCINQ13939 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCINQ13939 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCINQ13939 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CCINQ13939 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCINQ13939 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCINQ13939 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
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