Protein–RNA interactions for Protein: Q12033

RIM20, pH-response regulator protein palA/RIM20, yeastyeast

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RIM20Q12033 NUP82YJL061W 2142 nt2.31□□□□□ -2.04
RIM20Q12033 YJL127C-BYJL127C-B 159 nt2.31□□□□□ -2.04
RIM20Q12033 RPS17AYML024W 411 nt2.31□□□□□ -2.04
RIM20Q12033 GAL7YBR018C 1101 nt2.31□□□□□ -2.04
RIM20Q12033 VMA9YCL005W-A 222 nt2.31□□□□□ -2.04
RIM20Q12033 BNA7YDR428C 786 nt2.3□□□□□ -2.04
RIM20Q12033 TIM9YEL020W-A 264 nt2.3□□□□□ -2.04
RIM20Q12033 BIG1YHR101C 1008 nt2.3□□□□□ -2.04
RIM20Q12033 YHR130CYHR130C 336 nt2.3□□□□□ -2.04
RIM20Q12033 NCE101YJL205C 162 nt2.3□□□□□ -2.04
RIM20Q12033 FYV7YLR068W 456 nt2.3□□□□□ -2.04
RIM20Q12033 VTI1YMR197C 654 nt2.3□□□□□ -2.04
RIM20Q12033 ROX1YPR065W 1107 nt2.3□□□□□ -2.04
RIM20Q12033 PHO2YDL106C 1680 nt2.3□□□□□ -2.04
RIM20Q12033 SET2YJL168C 2202 nt2.3□□□□□ -2.04
RIM20Q12033 RRP6YOR001W 2202 nt2.3□□□□□ -2.04
RIM20Q12033 NOP14YDL148C 2433 nt2.3□□□□□ -2.04
RIM20Q12033 UBR1YGR184C 5853 nt2.29□□□□□ -2.04
RIM20Q12033 BNI1YNL271C 5862 nt2.29□□□□□ -2.04
RIM20Q12033 YBR012W-AYBR012W-A 1323 nt2.29□□□□□ -2.04
RIM20Q12033 YOR142W-AYOR142W-A 1323 nt2.29□□□□□ -2.04
RIM20Q12033 YPR158W-AYPR158W-A 1323 nt2.29□□□□□ -2.04
RIM20Q12033 MRP10YDL045W-A 288 nt2.29□□□□□ -2.04
RIM20Q12033 YEL030C-AYEL030C-A 315 nt2.29□□□□□ -2.04
RIM20Q12033 MSL1YIR009W 336 nt2.29□□□□□ -2.04
RIM20Q12033 GRX8YLR364W 330 nt2.29□□□□□ -2.04
RIM20Q12033 SEN15YMR059W 387 nt2.29□□□□□ -2.04
RIM20Q12033 PET123YOR158W 957 nt2.29□□□□□ -2.04
RIM20Q12033 MET18YIL128W 3099 nt2.28□□□□□ -2.04
RIM20Q12033 NOP10YHR072W-A 177 nt2.28□□□□□ -2.04
RIM20Q12033 YKL111CYKL111C 336 nt2.28□□□□□ -2.04
RIM20Q12033 YLR031WYLR031W 561 nt2.28□□□□□ -2.04
RIM20Q12033 ATP3YBR039W 936 nt2.28□□□□□ -2.04
RIM20Q12033 SLM6YBR266C 453 nt2.28□□□□□ -2.04
RIM20Q12033 MCD1YDL003W 1701 nt2.28□□□□□ -2.05
RIM20Q12033 CDC53YDL132W 2448 nt2.27□□□□□ -2.05
RIM20Q12033 YDR194W-AYDR194W-A 153 nt2.27□□□□□ -2.05
RIM20Q12033 MZM1YDR493W 372 nt2.27□□□□□ -2.05
RIM20Q12033 COX13YGL191W 390 nt2.27□□□□□ -2.05
RIM20Q12033 SMD1YGR074W 441 nt2.27□□□□□ -2.05
RIM20Q12033 VOA1YGR106C 798 nt2.27□□□□□ -2.05
RIM20Q12033 RPC10YHR143W-A 213 nt2.27□□□□□ -2.05
RIM20Q12033 tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 76 nt2.27□□□□□ -2.05
RIM20Q12033 RMP1YLR145W 606 nt2.27□□□□□ -2.05
RIM20Q12033 YBL012CYBL012C 402 nt2.27□□□□□ -2.05
RIM20Q12033 NOP15YNL110C 663 nt2.27□□□□□ -2.05
RIM20Q12033 BFA1YJR053W 1725 nt2.26□□□□□ -2.05
RIM20Q12033 YJL016WYJL016W 1686 nt2.26□□□□□ -2.05
RIM20Q12033 YER084W-AYER084W-A 513 nt2.26□□□□□ -2.05
RIM20Q12033 IRC19YLL033W 693 nt2.26□□□□□ -2.05
RIM20Q12033 YNL010WYNL010W 726 nt2.26□□□□□ -2.05
RIM20Q12033 ASM4YDL088C 1587 nt2.26□□□□□ -2.05
RIM20Q12033 YDR509WYDR509W 348 nt2.25□□□□□ -2.05
RIM20Q12033 YEL057CYEL057C 702 nt2.25□□□□□ -2.05
RIM20Q12033 DDR48YMR173W 1293 nt2.25□□□□□ -2.05
RIM20Q12033 CDC50YCR094W 1176 nt2.24□□□□□ -2.05
RIM20Q12033 BI2Q0110 1272 nt2.24□□□□□ -2.05
RIM20Q12033 YER188C-AYER188C-A 300 nt2.24□□□□□ -2.05
RIM20Q12033 SNC1YAL030W 354 nt2.24□□□□□ -2.05
RIM20Q12033 YKR051WYKR051W 1257 nt2.24□□□□□ -2.05
RIM20Q12033 TOR2YKL203C 7425 nt2.24□□□□□ -2.05
RIM20Q12033 AFI1YOR129C 2682 nt2.24□□□□□ -2.05
RIM20Q12033 YDL118WYDL118W 381 nt2.23□□□□□ -2.05
RIM20Q12033 RPF1YHR088W 888 nt2.23□□□□□ -2.05
RIM20Q12033 YLR171WYLR171W 390 nt2.23□□□□□ -2.05
RIM20Q12033 YOR248WYOR248W 303 nt2.23□□□□□ -2.05
RIM20Q12033 RPB5YBR154C 648 nt2.23□□□□□ -2.05
RIM20Q12033 SHE9YDR393W 1371 nt2.23□□□□□ -2.05
RIM20Q12033 VPS52YDR484W 1926 nt2.23□□□□□ -2.05
RIM20Q12033 SWT1YOR166C 1377 nt2.23□□□□□ -2.05
RIM20Q12033 SIR4YDR227W 4077 nt2.22□□□□□ -2.05
RIM20Q12033 KAP123YER110C 3342 nt2.22□□□□□ -2.05
RIM20Q12033 SPO22YIL073C 2928 nt2.22□□□□□ -2.05
RIM20Q12033 RNH70YGR276C 1662 nt2.22□□□□□ -2.05
RIM20Q12033 VPS35YJL154C 2835 nt2.22□□□□□ -2.05
RIM20Q12033 RPI1YIL119C 1224 nt2.22□□□□□ -2.05
RIM20Q12033 YDL041WYDL041W 354 nt2.21□□□□□ -2.06
RIM20Q12033 YML108WYML108W 318 nt2.21□□□□□ -2.06
RIM20Q12033 YMR052C-AYMR052C-A 366 nt2.21□□□□□ -2.06
RIM20Q12033 UBP15YMR304W 3693 nt2.21□□□□□ -2.06
RIM20Q12033 YMR324CYMR324C 243 nt2.21□□□□□ -2.06
RIM20Q12033 NIC96YFR002W 2520 nt2.21□□□□□ -2.06
RIM20Q12033 FKS1YLR342W 5631 nt2.21□□□□□ -2.06
RIM20Q12033 PEP1YBL017C 4740 nt2.2□□□□□ -2.06
RIM20Q12033 RTT107YHR154W 3213 nt2.2□□□□□ -2.06
RIM20Q12033 HMLALPHA2YCL067C 633 nt2.2□□□□□ -2.06
RIM20Q12033 MATALPHA2YCR039C 633 nt2.2□□□□□ -2.06
RIM20Q12033 SYM1YLR251W 594 nt2.2□□□□□ -2.06
RIM20Q12033 YOR333CYOR333C 417 nt2.2□□□□□ -2.06
RIM20Q12033 RTC6YPL183W-A 282 nt2.2□□□□□ -2.06
RIM20Q12033 IRC10YOL015W 1761 nt2.2□□□□□ -2.06
RIM20Q12033 YCR001WYCR001W 315 nt2.19□□□□□ -2.06
RIM20Q12033 COX7YMR256C 183 nt2.19□□□□□ -2.06
RIM20Q12033 YPR039WYPR039W 336 nt2.19□□□□□ -2.06
RIM20Q12033 SPC72YAL047C 1869 nt2.18□□□□□ -2.06
RIM20Q12033 YHR214W-AYHR214W-A 486 nt2.18□□□□□ -2.06
RIM20Q12033 YJL007CYJL007C 315 nt2.18□□□□□ -2.06
RIM20Q12033 AIM29YKR074W 468 nt2.18□□□□□ -2.06
RIM20Q12033 TEN1YLR010C 483 nt2.18□□□□□ -2.06
RIM20Q12033 YAR068WYAR068W 486 nt2.18□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 44 ms