Protein–RNA interactions for Protein: Q07837

SLC3A1, Neutral and basic amino acid transport protein rBAT, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC3A1Q07837 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC3A1Q07837 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC3A1Q07837 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC3A1Q07837 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC3A1Q07837 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC3A1Q07837 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC3A1Q07837 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC3A1Q07837 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC3A1Q07837 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC3A1Q07837 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC3A1Q07837 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC3A1Q07837 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC3A1Q07837 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC3A1Q07837 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC3A1Q07837 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC3A1Q07837 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC3A1Q07837 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC3A1Q07837 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC3A1Q07837 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC3A1Q07837 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC3A1Q07837 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC3A1Q07837 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC3A1Q07837 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC3A1Q07837 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC3A1Q07837 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC3A1Q07837 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC3A1Q07837 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC3A1Q07837 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC3A1Q07837 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC3A1Q07837 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC3A1Q07837 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC3A1Q07837 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC3A1Q07837 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC3A1Q07837 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC3A1Q07837 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC3A1Q07837 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC3A1Q07837 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC3A1Q07837 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC3A1Q07837 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC3A1Q07837 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC3A1Q07837 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC3A1Q07837 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC3A1Q07837 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC3A1Q07837 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC3A1Q07837 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC3A1Q07837 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC3A1Q07837 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC3A1Q07837 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC3A1Q07837 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC3A1Q07837 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC3A1Q07837 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC3A1Q07837 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC3A1Q07837 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC3A1Q07837 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC3A1Q07837 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC3A1Q07837 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC3A1Q07837 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC3A1Q07837 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC3A1Q07837 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC3A1Q07837 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC3A1Q07837 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC3A1Q07837 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC3A1Q07837 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC3A1Q07837 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC3A1Q07837 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC3A1Q07837 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC3A1Q07837 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC3A1Q07837 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC3A1Q07837 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC3A1Q07837 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC3A1Q07837 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC3A1Q07837 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC3A1Q07837 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC3A1Q07837 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC3A1Q07837 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC3A1Q07837 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC3A1Q07837 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC3A1Q07837 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC3A1Q07837 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC3A1Q07837 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC3A1Q07837 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC3A1Q07837 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC3A1Q07837 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC3A1Q07837 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC3A1Q07837 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC3A1Q07837 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC3A1Q07837 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC3A1Q07837 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC3A1Q07837 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC3A1Q07837 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC3A1Q07837 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC3A1Q07837 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC3A1Q07837 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC3A1Q07837 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC3A1Q07837 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC3A1Q07837 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
SLC3A1Q07837 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC3A1Q07837 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC3A1Q07837 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC3A1Q07837 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms