Protein–RNA interactions for Protein: Q02983

RRN5, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN5, yeastyeast

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRN5Q02983 YLR140WYLR140W 327 nt1.5□□□□□ -2.17
RRN5Q02983 YBL107W-AYBL107W-A 105 nt1.5□□□□□ -2.17
RRN5Q02983 SLS1YLR139C 1932 nt1.5□□□□□ -2.17
RRN5Q02983 SAG1YJR004C 1953 nt1.49□□□□□ -2.17
RRN5Q02983 YER088C-AYER088C-A 324 nt1.49□□□□□ -2.17
RRN5Q02983 YBL068W-AYBL068W-A 237 nt1.49□□□□□ -2.17
RRN5Q02983 MNL2YLR057W 2550 nt1.49□□□□□ -2.17
RRN5Q02983 CTR9YOL145C 3234 nt1.48□□□□□ -2.17
RRN5Q02983 YDR210W-AYDR210W-A 1317 nt1.48□□□□□ -2.17
RRN5Q02983 YOR343W-AYOR343W-A 1317 nt1.48□□□□□ -2.17
RRN5Q02983 SHE4YOR035C 2370 nt1.48□□□□□ -2.17
RRN5Q02983 snR59snR59 78 nt1.48□□□□□ -2.17
RRN5Q02983 GPX2YBR244W 489 nt1.48□□□□□ -2.17
RRN5Q02983 YCR043CYCR043C 384 nt1.47□□□□□ -2.17
RRN5Q02983 IRC2YDR112W 309 nt1.47□□□□□ -2.17
RRN5Q02983 SMD3YLR147C 306 nt1.47□□□□□ -2.17
RRN5Q02983 CSI1YMR025W 888 nt1.47□□□□□ -2.17
RRN5Q02983 PET123YOR158W 957 nt1.47□□□□□ -2.17
RRN5Q02983 MSC6YOR354C 2079 nt1.46□□□□□ -2.18
RRN5Q02983 SEC21YNL287W 2808 nt1.46□□□□□ -2.18
RRN5Q02983 NCA2YPR155C 1851 nt1.46□□□□□ -2.18
RRN5Q02983 CCH1YGR217W 6120 nt1.46□□□□□ -2.18
RRN5Q02983 YDR194W-AYDR194W-A 153 nt1.46□□□□□ -2.18
RRN5Q02983 MPC1YGL080W 393 nt1.46□□□□□ -2.18
RRN5Q02983 YNL226WYNL226W 411 nt1.46□□□□□ -2.18
RRN5Q02983 RTC6YPL183W-A 282 nt1.46□□□□□ -2.18
RRN5Q02983 SSK2YNR031C 4740 nt1.46□□□□□ -2.18
RRN5Q02983 YLR149CYLR149C 2193 nt1.46□□□□□ -2.18
RRN5Q02983 BPH1YCR032W 6504 nt1.45□□□□□ -2.18
RRN5Q02983 RSM27YGR215W 333 nt1.45□□□□□ -2.18
RRN5Q02983 RPC25YKL144C 639 nt1.45□□□□□ -2.18
RRN5Q02983 MRPS8YMR158W 468 nt1.45□□□□□ -2.18
RRN5Q02983 COA6YMR244C-A 315 nt1.45□□□□□ -2.18
RRN5Q02983 EGD1YPL037C 474 nt1.45□□□□□ -2.18
RRN5Q02983 KAP122YGL016W 3246 nt1.45□□□□□ -2.18
RRN5Q02983 NOT5YPR072W 1683 nt1.45□□□□□ -2.18
RRN5Q02983 NUP120YKL057C 3114 nt1.44□□□□□ -2.18
RRN5Q02983 KAR1YNL188W 1302 nt1.44□□□□□ -2.18
RRN5Q02983 RBK1YCR036W 1002 nt1.44□□□□□ -2.18
RRN5Q02983 YJL015CYJL015C 285 nt1.44□□□□□ -2.18
RRN5Q02983 ATP15YPL271W 189 nt1.44□□□□□ -2.18
RRN5Q02983 FYV8YGR196C 2454 nt1.44□□□□□ -2.18
RRN5Q02983 RLM1YPL089C 2031 nt1.44□□□□□ -2.18
RRN5Q02983 DPB11YJL090C 2295 nt1.43□□□□□ -2.18
RRN5Q02983 EST2YLR318W 2655 nt1.43□□□□□ -2.18
RRN5Q02983 MSN5YDR335W 3675 nt1.43□□□□□ -2.18
RRN5Q02983 YDR115WYDR115W 318 nt1.43□□□□□ -2.18
RRN5Q02983 RNR4YGR180C 1038 nt1.43□□□□□ -2.18
RRN5Q02983 LIN1YHR156C 1023 nt1.43□□□□□ -2.18
RRN5Q02983 YBL083CYBL083C 426 nt1.43□□□□□ -2.18
RRN5Q02983 YOR364WYOR364W 369 nt1.43□□□□□ -2.18
RRN5Q02983 TRM3YDL112W 4311 nt1.43□□□□□ -2.18
RRN5Q02983 ALK1YGL021W 2283 nt1.42□□□□□ -2.18
RRN5Q02983 MLH3YPL164C 2148 nt1.42□□□□□ -2.18
RRN5Q02983 BNA7YDR428C 786 nt1.42□□□□□ -2.18
RRN5Q02983 TDA2YER071C 381 nt1.42□□□□□ -2.18
RRN5Q02983 YFR057WYFR057W 456 nt1.42□□□□□ -2.18
RRN5Q02983 YGL024WYGL024W 336 nt1.42□□□□□ -2.18
RRN5Q02983 YIL102CYIL102C 306 nt1.42□□□□□ -2.18
RRN5Q02983 YLR217WYLR217W 324 nt1.42□□□□□ -2.18
RRN5Q02983 SEN15YMR059W 387 nt1.42□□□□□ -2.18
RRN5Q02983 BRX1YOL077C 876 nt1.42□□□□□ -2.18
RRN5Q02983 PET127YOR017W 2403 nt1.42□□□□□ -2.18
RRN5Q02983 YER158W-AYER158W-A 216 nt1.41□□□□□ -2.18
RRN5Q02983 DFG10YIL049W 762 nt1.41□□□□□ -2.18
RRN5Q02983 YLR307C-AYLR307C-A 264 nt1.41□□□□□ -2.18
RRN5Q02983 YPL080CYPL080C 327 nt1.41□□□□□ -2.18
RRN5Q02983 CAT8YMR280C 4302 nt1.41□□□□□ -2.18
RRN5Q02983 BRR2YER172C 6492 nt1.4□□□□□ -2.18
RRN5Q02983 NUP192YJL039C 5052 nt1.4□□□□□ -2.19
RRN5Q02983 RSM22YKL155C 1887 nt1.4□□□□□ -2.19
RRN5Q02983 MRPL32YCR003W 552 nt1.4□□□□□ -2.19
RRN5Q02983 ACF4YJR083C 930 nt1.4□□□□□ -2.19
RRN5Q02983 ARV1YLR242C 966 nt1.4□□□□□ -2.19
RRN5Q02983 URA10YMR271C 684 nt1.4□□□□□ -2.19
RRN5Q02983 YDR537CYDR537C 606 nt1.39□□□□□ -2.19
RRN5Q02983 YJL022WYJL022W 309 nt1.39□□□□□ -2.19
RRN5Q02983 VPS55YJR044C 423 nt1.39□□□□□ -2.19
RRN5Q02983 CMS1YLR003C 876 nt1.39□□□□□ -2.19
RRN5Q02983 YOR152CYOR152C 771 nt1.39□□□□□ -2.19
RRN5Q02983 YDL068WYDL068W 330 nt1.38□□□□□ -2.19
RRN5Q02983 YER038W-AYER038W-A 381 nt1.38□□□□□ -2.19
RRN5Q02983 TAD1YGL243W 1203 nt1.38□□□□□ -2.19
RRN5Q02983 COF1YLL050C 432 nt1.38□□□□□ -2.19
RRN5Q02983 SFB2YNL049C 2631 nt1.38□□□□□ -2.19
RRN5Q02983 tQ(UUG)E2tQ(UUG)E2 72 nt1.37□□□□□ -2.19
RRN5Q02983 PFD1YJL179W 330 nt1.37□□□□□ -2.19
RRN5Q02983 VAM3YOR106W 852 nt1.37□□□□□ -2.19
RRN5Q02983 YPR177CYPR177C 372 nt1.37□□□□□ -2.19
RRN5Q02983 YBR224WYBR224W 516 nt1.37□□□□□ -2.19
RRN5Q02983 NUP82YJL061W 2142 nt1.37□□□□□ -2.19
RRN5Q02983 DOT6YER088C 2013 nt1.37□□□□□ -2.19
RRN5Q02983 SGD1YLR336C 2700 nt1.37□□□□□ -2.19
RRN5Q02983 GNT1YOR320C 1476 nt1.37□□□□□ -2.19
RRN5Q02983 CDC36YDL165W 576 nt1.36□□□□□ -2.19
RRN5Q02983 CIC1YHR052W 1131 nt1.36□□□□□ -2.19
RRN5Q02983 RRT15YLR162W-A 189 nt1.36□□□□□ -2.19
RRN5Q02983 SEC22YLR268W 645 nt1.36□□□□□ -2.19
RRN5Q02983 RPS7BYNL096C 573 nt1.36□□□□□ -2.19
RRN5Q02983 PEP3YLR148W 2757 nt1.36□□□□□ -2.19
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 44.8 ms