Protein–RNA interactions for Protein: Q02100

SKO1, CRE-binding bZIP protein SKO1, yeastyeast

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Length 647 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SKO1Q02100 SVL3YPL032C 2478 nt2.08□□□□□ -2.08
SKO1Q02100 VTC3YPL019C 2508 nt2.08□□□□□ -2.08
SKO1Q02100 RPF1YHR088W 888 nt2.08□□□□□ -2.08
SKO1Q02100 BET3YKR068C 582 nt2.08□□□□□ -2.08
SKO1Q02100 PEX17YNL214W 600 nt2.08□□□□□ -2.08
SKO1Q02100 JID1YPR061C 906 nt2.08□□□□□ -2.08
SKO1Q02100 VPH1YOR270C 2523 nt2.08□□□□□ -2.08
SKO1Q02100 RTT10YPL183C 3042 nt2.07□□□□□ -2.08
SKO1Q02100 VPS35YJL154C 2835 nt2.07□□□□□ -2.08
SKO1Q02100 KAP123YER110C 3342 nt2.07□□□□□ -2.08
SKO1Q02100 YDL041WYDL041W 354 nt2.07□□□□□ -2.08
SKO1Q02100 LSO2YGR169C-A 279 nt2.07□□□□□ -2.08
SKO1Q02100 YBR076C-AYBR076C-A 267 nt2.07□□□□□ -2.08
SKO1Q02100 SHE9YDR393W 1371 nt2.07□□□□□ -2.08
SKO1Q02100 RUD3YOR216C 1455 nt2.07□□□□□ -2.08
SKO1Q02100 RNH70YGR276C 1662 nt2.06□□□□□ -2.08
SKO1Q02100 SPF1YEL031W 3648 nt2.06□□□□□ -2.08
SKO1Q02100 SPC72YAL047C 1869 nt2.06□□□□□ -2.08
SKO1Q02100 PEX4YGR133W 552 nt2.06□□□□□ -2.08
SKO1Q02100 RPI1YIL119C 1224 nt2.06□□□□□ -2.08
SKO1Q02100 PSY1YKL076C 384 nt2.06□□□□□ -2.08
SKO1Q02100 YOR248WYOR248W 303 nt2.06□□□□□ -2.08
SKO1Q02100 SNC2YOR327C 348 nt2.06□□□□□ -2.08
SKO1Q02100 SPC29YPL124W 762 nt2.06□□□□□ -2.08
SKO1Q02100 MNE1YOR350C 1992 nt2.06□□□□□ -2.08
SKO1Q02100 YMR045CYMR045C 5268 nt2.06□□□□□ -2.08
SKO1Q02100 MUD2YKL074C 1584 nt2.06□□□□□ -2.08
SKO1Q02100 NOP14YDL148C 2433 nt2.06□□□□□ -2.08
SKO1Q02100 TRL1YJL087C 2484 nt2.06□□□□□ -2.08
SKO1Q02100 SLN1YIL147C 3663 nt2.05□□□□□ -2.08
SKO1Q02100 SOK2YMR016C 2358 nt2.05□□□□□ -2.08
SKO1Q02100 YEL057CYEL057C 702 nt2.05□□□□□ -2.08
SKO1Q02100 BI2Q0110 1272 nt2.05□□□□□ -2.08
SKO1Q02100 HOP2YGL033W 657 nt2.05□□□□□ -2.08
SKO1Q02100 YIL156W-BYIL156W-B 222 nt2.05□□□□□ -2.08
SKO1Q02100 PAU14YIL176C 363 nt2.05□□□□□ -2.08
SKO1Q02100 PAU1YJL223C 363 nt2.05□□□□□ -2.08
SKO1Q02100 SEC22YLR268W 645 nt2.05□□□□□ -2.08
SKO1Q02100 SWT1YOR166C 1377 nt2.05□□□□□ -2.08
SKO1Q02100 ASM4YDL088C 1587 nt2.05□□□□□ -2.08
SKO1Q02100 PPN1YDR452W 2025 nt2.05□□□□□ -2.08
SKO1Q02100 CRM1YGR218W 3255 nt2.04□□□□□ -2.08
SKO1Q02100 VMR1YHL035C 4779 nt2.04□□□□□ -2.08
SKO1Q02100 YLR171WYLR171W 390 nt2.04□□□□□ -2.08
SKO1Q02100 YML108WYML108W 318 nt2.04□□□□□ -2.08
SKO1Q02100 YPR039WYPR039W 336 nt2.04□□□□□ -2.08
SKO1Q02100 IST2YBR086C 2841 nt2.04□□□□□ -2.08
SKO1Q02100 DAD3YBR233W-A 285 nt2.04□□□□□ -2.08
SKO1Q02100 SCP160YJL080C 3669 nt2.04□□□□□ -2.08
SKO1Q02100 YHR214C-BYHR214C-B 5382 nt2.04□□□□□ -2.08
SKO1Q02100 RTT107YHR154W 3213 nt2.03□□□□□ -2.08
SKO1Q02100 NUP120YKL057C 3114 nt2.03□□□□□ -2.08
SKO1Q02100 snR79snR79 84 nt2.03□□□□□ -2.08
SKO1Q02100 YDR286CYDR286C 345 nt2.03□□□□□ -2.08
SKO1Q02100 YKR051WYKR051W 1257 nt2.03□□□□□ -2.08
SKO1Q02100 AIM29YKR074W 468 nt2.03□□□□□ -2.08
SKO1Q02100 YLR269CYLR269C 351 nt2.03□□□□□ -2.08
SKO1Q02100 CHC1YGL206C 4962 nt2.03□□□□□ -2.08
SKO1Q02100 TMN3YER113C 2121 nt2.03□□□□□ -2.08
SKO1Q02100 RGA1YOR127W 3024 nt2.03□□□□□ -2.08
SKO1Q02100 PHO91YNR013C 2685 nt2.03□□□□□ -2.09
SKO1Q02100 RTT101YJL047C 2529 nt2.02□□□□□ -2.09
SKO1Q02100 KAR3YPR141C 2190 nt2.02□□□□□ -2.09
SKO1Q02100 HMLALPHA2YCL067C 633 nt2.02□□□□□ -2.09
SKO1Q02100 MATALPHA2YCR039C 633 nt2.02□□□□□ -2.09
SKO1Q02100 YHR214W-AYHR214W-A 486 nt2.02□□□□□ -2.09
SKO1Q02100 YAL059C-AYAL059C-A 423 nt2.02□□□□□ -2.09
SKO1Q02100 YKR075W-AYKR075W-A 270 nt2.02□□□□□ -2.09
SKO1Q02100 YLR053CYLR053C 327 nt2.02□□□□□ -2.09
SKO1Q02100 YAR068WYAR068W 486 nt2.02□□□□□ -2.09
SKO1Q02100 VPS20YMR077C 666 nt2.02□□□□□ -2.09
SKO1Q02100 VPS8YAL002W 3825 nt2.02□□□□□ -2.09
SKO1Q02100 STH1YIL126W 4080 nt2.01□□□□□ -2.09
SKO1Q02100 STB4YMR019W 2850 nt2.01□□□□□ -2.09
SKO1Q02100 YOR192C-AYOR192C-A 1317 nt2.01□□□□□ -2.09
SKO1Q02100 YCR001WYCR001W 315 nt2.01□□□□□ -2.09
SKO1Q02100 TEN1YLR010C 483 nt2.01□□□□□ -2.09
SKO1Q02100 SYM1YLR251W 594 nt2.01□□□□□ -2.09
SKO1Q02100 YOR394C-AYOR394C-A 168 nt2.01□□□□□ -2.09
SKO1Q02100 TSC3YBR058C-A 243 nt2.01□□□□□ -2.09
SKO1Q02100 RIC1YLR039C 3171 nt2.01□□□□□ -2.09
SKO1Q02100 MSB1YOR188W 3414 nt2.01□□□□□ -2.09
SKO1Q02100 CDC27YBL084C 2277 nt2□□□□□ -2.09
SKO1Q02100 YER068C-AYER068C-A 432 nt2□□□□□ -2.09
SKO1Q02100 GET1YGL020C 708 nt2□□□□□ -2.09
SKO1Q02100 YGL069CYGL069C 465 nt2□□□□□ -2.09
SKO1Q02100 YHR125WYHR125W 306 nt2□□□□□ -2.09
SKO1Q02100 TOM22YNL131W 459 nt2□□□□□ -2.09
SKO1Q02100 APL5YPL195W 2799 nt2□□□□□ -2.09
SKO1Q02100 CDC60YPL160W 3273 nt2□□□□□ -2.09
SKO1Q02100 INO80YGL150C 4470 nt1.99□□□□□ -2.09
SKO1Q02100 COS111YBR203W 2775 nt1.99□□□□□ -2.09
SKO1Q02100 CDC24YAL041W 2565 nt1.99□□□□□ -2.09
SKO1Q02100 YCR064CYCR064C 411 nt1.99□□□□□ -2.09
SKO1Q02100 YGR025WYGR025W 303 nt1.99□□□□□ -2.09
SKO1Q02100 ECL1YGR146C 636 nt1.99□□□□□ -2.09
SKO1Q02100 HSK3YKL138C-A 210 nt1.99□□□□□ -2.09
SKO1Q02100 snR13snR13 124 nt1.99□□□□□ -2.09
SKO1Q02100 NUP170YBL079W 4509 nt1.99□□□□□ -2.09
SKO1Q02100 SGD1YLR336C 2700 nt1.99□□□□□ -2.09
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