Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFITM3Q01628 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFITM3Q01628 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFITM3Q01628 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFITM3Q01628 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFITM3Q01628 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFITM3Q01628 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFITM3Q01628 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFITM3Q01628 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
IFITM3Q01628 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFITM3Q01628 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFITM3Q01628 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFITM3Q01628 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFITM3Q01628 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFITM3Q01628 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFITM3Q01628 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IFITM3Q01628 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IFITM3Q01628 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IFITM3Q01628 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IFITM3Q01628 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IFITM3Q01628 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IFITM3Q01628 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IFITM3Q01628 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IFITM3Q01628 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IFITM3Q01628 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IFITM3Q01628 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IFITM3Q01628 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IFITM3Q01628 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IFITM3Q01628 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IFITM3Q01628 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IFITM3Q01628 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IFITM3Q01628 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IFITM3Q01628 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IFITM3Q01628 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IFITM3Q01628 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IFITM3Q01628 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IFITM3Q01628 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IFITM3Q01628 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IFITM3Q01628 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IFITM3Q01628 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IFITM3Q01628 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IFITM3Q01628 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
IFITM3Q01628 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
IFITM3Q01628 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IFITM3Q01628 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IFITM3Q01628 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IFITM3Q01628 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IFITM3Q01628 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IFITM3Q01628 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IFITM3Q01628 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IFITM3Q01628 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IFITM3Q01628 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
IFITM3Q01628 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IFITM3Q01628 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IFITM3Q01628 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IFITM3Q01628 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IFITM3Q01628 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IFITM3Q01628 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IFITM3Q01628 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
IFITM3Q01628 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IFITM3Q01628 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IFITM3Q01628 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IFITM3Q01628 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
IFITM3Q01628 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IFITM3Q01628 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IFITM3Q01628 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IFITM3Q01628 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IFITM3Q01628 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IFITM3Q01628 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IFITM3Q01628 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IFITM3Q01628 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IFITM3Q01628 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IFITM3Q01628 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IFITM3Q01628 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IFITM3Q01628 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IFITM3Q01628 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IFITM3Q01628 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IFITM3Q01628 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IFITM3Q01628 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
IFITM3Q01628 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IFITM3Q01628 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IFITM3Q01628 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IFITM3Q01628 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IFITM3Q01628 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IFITM3Q01628 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IFITM3Q01628 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IFITM3Q01628 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IFITM3Q01628 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IFITM3Q01628 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IFITM3Q01628 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IFITM3Q01628 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IFITM3Q01628 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IFITM3Q01628 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IFITM3Q01628 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IFITM3Q01628 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IFITM3Q01628 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IFITM3Q01628 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IFITM3Q01628 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IFITM3Q01628 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IFITM3Q01628 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms