Protein–RNA interactions for Protein: Q01064

PDE1B, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, humanhuman

Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1BQ01064 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
PDE1BQ01064 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDE1BQ01064 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDE1BQ01064 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDE1BQ01064 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDE1BQ01064 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDE1BQ01064 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDE1BQ01064 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDE1BQ01064 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDE1BQ01064 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDE1BQ01064 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDE1BQ01064 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDE1BQ01064 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDE1BQ01064 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDE1BQ01064 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDE1BQ01064 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDE1BQ01064 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDE1BQ01064 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDE1BQ01064 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDE1BQ01064 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDE1BQ01064 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDE1BQ01064 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDE1BQ01064 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDE1BQ01064 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDE1BQ01064 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDE1BQ01064 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDE1BQ01064 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDE1BQ01064 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDE1BQ01064 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDE1BQ01064 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDE1BQ01064 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PDE1BQ01064 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PDE1BQ01064 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDE1BQ01064 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDE1BQ01064 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDE1BQ01064 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDE1BQ01064 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDE1BQ01064 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDE1BQ01064 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDE1BQ01064 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDE1BQ01064 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDE1BQ01064 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDE1BQ01064 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDE1BQ01064 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDE1BQ01064 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDE1BQ01064 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDE1BQ01064 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDE1BQ01064 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDE1BQ01064 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDE1BQ01064 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDE1BQ01064 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDE1BQ01064 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDE1BQ01064 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDE1BQ01064 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDE1BQ01064 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDE1BQ01064 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDE1BQ01064 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDE1BQ01064 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDE1BQ01064 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDE1BQ01064 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDE1BQ01064 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDE1BQ01064 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDE1BQ01064 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDE1BQ01064 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDE1BQ01064 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
PDE1BQ01064 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDE1BQ01064 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDE1BQ01064 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDE1BQ01064 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDE1BQ01064 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDE1BQ01064 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDE1BQ01064 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDE1BQ01064 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDE1BQ01064 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDE1BQ01064 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDE1BQ01064 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDE1BQ01064 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDE1BQ01064 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDE1BQ01064 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDE1BQ01064 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDE1BQ01064 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDE1BQ01064 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDE1BQ01064 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDE1BQ01064 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDE1BQ01064 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDE1BQ01064 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDE1BQ01064 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDE1BQ01064 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
PDE1BQ01064 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDE1BQ01064 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDE1BQ01064 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDE1BQ01064 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDE1BQ01064 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDE1BQ01064 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDE1BQ01064 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDE1BQ01064 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDE1BQ01064 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDE1BQ01064 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDE1BQ01064 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDE1BQ01064 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms