Protein–RNA interactions for Protein: P60606

CTXN1, Cortexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 82 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN1P60606 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CTXN1P60606 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTXN1P60606 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTXN1P60606 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTXN1P60606 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTXN1P60606 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTXN1P60606 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CTXN1P60606 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CTXN1P60606 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CTXN1P60606 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CTXN1P60606 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CTXN1P60606 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CTXN1P60606 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CTXN1P60606 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTXN1P60606 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTXN1P60606 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTXN1P60606 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CTXN1P60606 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTXN1P60606 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTXN1P60606 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTXN1P60606 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CTXN1P60606 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTXN1P60606 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTXN1P60606 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTXN1P60606 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTXN1P60606 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTXN1P60606 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTXN1P60606 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTXN1P60606 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTXN1P60606 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTXN1P60606 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTXN1P60606 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTXN1P60606 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTXN1P60606 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTXN1P60606 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTXN1P60606 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTXN1P60606 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTXN1P60606 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTXN1P60606 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTXN1P60606 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTXN1P60606 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTXN1P60606 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTXN1P60606 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTXN1P60606 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTXN1P60606 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTXN1P60606 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTXN1P60606 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTXN1P60606 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTXN1P60606 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTXN1P60606 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTXN1P60606 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTXN1P60606 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTXN1P60606 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTXN1P60606 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTXN1P60606 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTXN1P60606 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTXN1P60606 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTXN1P60606 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTXN1P60606 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTXN1P60606 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CTXN1P60606 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTXN1P60606 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTXN1P60606 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTXN1P60606 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTXN1P60606 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTXN1P60606 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTXN1P60606 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTXN1P60606 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTXN1P60606 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTXN1P60606 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTXN1P60606 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTXN1P60606 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTXN1P60606 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTXN1P60606 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTXN1P60606 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTXN1P60606 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTXN1P60606 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTXN1P60606 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CTXN1P60606 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTXN1P60606 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTXN1P60606 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTXN1P60606 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTXN1P60606 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTXN1P60606 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTXN1P60606 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTXN1P60606 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTXN1P60606 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTXN1P60606 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTXN1P60606 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTXN1P60606 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTXN1P60606 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTXN1P60606 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTXN1P60606 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTXN1P60606 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTXN1P60606 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTXN1P60606 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTXN1P60606 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTXN1P60606 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTXN1P60606 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTXN1P60606 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms