Protein–RNA interactions for Protein: P60602

ROMO1, Reactive oxygen species modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROMO1P60602 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.48□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.89
ROMO1P60602 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms