Protein–RNA interactions for Protein: P54284

CACNB3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB3P54284 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CACNB3P54284 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CACNB3P54284 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CACNB3P54284 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CACNB3P54284 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CACNB3P54284 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CACNB3P54284 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CACNB3P54284 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CACNB3P54284 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CACNB3P54284 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CACNB3P54284 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CACNB3P54284 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CACNB3P54284 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CACNB3P54284 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CACNB3P54284 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CACNB3P54284 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CACNB3P54284 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CACNB3P54284 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CACNB3P54284 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CACNB3P54284 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CACNB3P54284 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CACNB3P54284 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CACNB3P54284 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CACNB3P54284 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNB3P54284 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNB3P54284 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNB3P54284 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNB3P54284 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNB3P54284 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNB3P54284 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNB3P54284 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNB3P54284 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNB3P54284 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNB3P54284 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNB3P54284 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNB3P54284 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNB3P54284 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNB3P54284 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNB3P54284 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNB3P54284 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNB3P54284 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNB3P54284 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNB3P54284 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNB3P54284 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CACNB3P54284 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CACNB3P54284 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CACNB3P54284 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CACNB3P54284 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CACNB3P54284 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CACNB3P54284 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CACNB3P54284 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CACNB3P54284 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CACNB3P54284 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CACNB3P54284 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CACNB3P54284 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CACNB3P54284 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CACNB3P54284 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CACNB3P54284 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CACNB3P54284 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CACNB3P54284 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CACNB3P54284 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CACNB3P54284 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CACNB3P54284 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CACNB3P54284 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CACNB3P54284 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CACNB3P54284 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CACNB3P54284 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CACNB3P54284 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CACNB3P54284 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CACNB3P54284 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CACNB3P54284 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CACNB3P54284 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CACNB3P54284 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CACNB3P54284 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CACNB3P54284 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CACNB3P54284 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CACNB3P54284 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CACNB3P54284 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CACNB3P54284 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CACNB3P54284 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CACNB3P54284 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CACNB3P54284 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CACNB3P54284 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CACNB3P54284 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CACNB3P54284 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CACNB3P54284 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CACNB3P54284 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CACNB3P54284 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CACNB3P54284 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CACNB3P54284 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CACNB3P54284 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CACNB3P54284 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CACNB3P54284 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CACNB3P54284 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CACNB3P54284 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CACNB3P54284 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CACNB3P54284 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CACNB3P54284 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CACNB3P54284 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CACNB3P54284 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms