Protein–RNA interactions for Protein: P42262

GRIA2, Glutamate receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA2P42262 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GRIA2P42262 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GRIA2P42262 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GRIA2P42262 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GRIA2P42262 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GRIA2P42262 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GRIA2P42262 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GRIA2P42262 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GRIA2P42262 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GRIA2P42262 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GRIA2P42262 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GRIA2P42262 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GRIA2P42262 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GRIA2P42262 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GRIA2P42262 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GRIA2P42262 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GRIA2P42262 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GRIA2P42262 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GRIA2P42262 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GRIA2P42262 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GRIA2P42262 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GRIA2P42262 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GRIA2P42262 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GRIA2P42262 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GRIA2P42262 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GRIA2P42262 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GRIA2P42262 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GRIA2P42262 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GRIA2P42262 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GRIA2P42262 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GRIA2P42262 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GRIA2P42262 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GRIA2P42262 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GRIA2P42262 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GRIA2P42262 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GRIA2P42262 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GRIA2P42262 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GRIA2P42262 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GRIA2P42262 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GRIA2P42262 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GRIA2P42262 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GRIA2P42262 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GRIA2P42262 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GRIA2P42262 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GRIA2P42262 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GRIA2P42262 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GRIA2P42262 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GRIA2P42262 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GRIA2P42262 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
GRIA2P42262 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GRIA2P42262 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
GRIA2P42262 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GRIA2P42262 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GRIA2P42262 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GRIA2P42262 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GRIA2P42262 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GRIA2P42262 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GRIA2P42262 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GRIA2P42262 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GRIA2P42262 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GRIA2P42262 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GRIA2P42262 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GRIA2P42262 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GRIA2P42262 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GRIA2P42262 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GRIA2P42262 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GRIA2P42262 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GRIA2P42262 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GRIA2P42262 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GRIA2P42262 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GRIA2P42262 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GRIA2P42262 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GRIA2P42262 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GRIA2P42262 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GRIA2P42262 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GRIA2P42262 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GRIA2P42262 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GRIA2P42262 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GRIA2P42262 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GRIA2P42262 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GRIA2P42262 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GRIA2P42262 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GRIA2P42262 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GRIA2P42262 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GRIA2P42262 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GRIA2P42262 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GRIA2P42262 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GRIA2P42262 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GRIA2P42262 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GRIA2P42262 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
GRIA2P42262 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
GRIA2P42262 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
GRIA2P42262 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GRIA2P42262 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GRIA2P42262 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GRIA2P42262 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GRIA2P42262 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GRIA2P42262 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GRIA2P42262 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GRIA2P42262 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms