Protein–RNA interactions for Protein: P35226

BMI1, Polycomb complex protein BMI-1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMI1P35226 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BMI1P35226 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BMI1P35226 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BMI1P35226 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BMI1P35226 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BMI1P35226 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BMI1P35226 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BMI1P35226 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BMI1P35226 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BMI1P35226 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BMI1P35226 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BMI1P35226 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BMI1P35226 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BMI1P35226 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BMI1P35226 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BMI1P35226 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BMI1P35226 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BMI1P35226 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BMI1P35226 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BMI1P35226 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BMI1P35226 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BMI1P35226 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BMI1P35226 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BMI1P35226 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
BMI1P35226 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BMI1P35226 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BMI1P35226 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BMI1P35226 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BMI1P35226 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BMI1P35226 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BMI1P35226 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BMI1P35226 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BMI1P35226 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BMI1P35226 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BMI1P35226 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BMI1P35226 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BMI1P35226 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BMI1P35226 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BMI1P35226 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BMI1P35226 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BMI1P35226 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BMI1P35226 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BMI1P35226 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BMI1P35226 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BMI1P35226 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BMI1P35226 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BMI1P35226 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BMI1P35226 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BMI1P35226 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BMI1P35226 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BMI1P35226 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BMI1P35226 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BMI1P35226 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BMI1P35226 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BMI1P35226 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BMI1P35226 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BMI1P35226 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BMI1P35226 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BMI1P35226 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BMI1P35226 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BMI1P35226 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BMI1P35226 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BMI1P35226 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BMI1P35226 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BMI1P35226 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BMI1P35226 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BMI1P35226 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BMI1P35226 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BMI1P35226 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BMI1P35226 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BMI1P35226 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BMI1P35226 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
BMI1P35226 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BMI1P35226 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BMI1P35226 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
BMI1P35226 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BMI1P35226 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BMI1P35226 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BMI1P35226 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BMI1P35226 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BMI1P35226 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BMI1P35226 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BMI1P35226 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BMI1P35226 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
BMI1P35226 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
BMI1P35226 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
BMI1P35226 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
BMI1P35226 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
BMI1P35226 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
BMI1P35226 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
BMI1P35226 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
BMI1P35226 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
BMI1P35226 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
BMI1P35226 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
BMI1P35226 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
BMI1P35226 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
BMI1P35226 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BMI1P35226 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BMI1P35226 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BMI1P35226 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms