Protein–RNA interactions for Protein: P31273

HOXC8, Homeobox protein Hox-C8, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC8P31273 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXC8P31273 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXC8P31273 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXC8P31273 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXC8P31273 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXC8P31273 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXC8P31273 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXC8P31273 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXC8P31273 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXC8P31273 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXC8P31273 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXC8P31273 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXC8P31273 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXC8P31273 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXC8P31273 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXC8P31273 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXC8P31273 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXC8P31273 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXC8P31273 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXC8P31273 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXC8P31273 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXC8P31273 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXC8P31273 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXC8P31273 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXC8P31273 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXC8P31273 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXC8P31273 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXC8P31273 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXC8P31273 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXC8P31273 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXC8P31273 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXC8P31273 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXC8P31273 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXC8P31273 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXC8P31273 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXC8P31273 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXC8P31273 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXC8P31273 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXC8P31273 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HOXC8P31273 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HOXC8P31273 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXC8P31273 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXC8P31273 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXC8P31273 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXC8P31273 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXC8P31273 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXC8P31273 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXC8P31273 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXC8P31273 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXC8P31273 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXC8P31273 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXC8P31273 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXC8P31273 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXC8P31273 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXC8P31273 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXC8P31273 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXC8P31273 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXC8P31273 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXC8P31273 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXC8P31273 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXC8P31273 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXC8P31273 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXC8P31273 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXC8P31273 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXC8P31273 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXC8P31273 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXC8P31273 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXC8P31273 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXC8P31273 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXC8P31273 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXC8P31273 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXC8P31273 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXC8P31273 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXC8P31273 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXC8P31273 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXC8P31273 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXC8P31273 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXC8P31273 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXC8P31273 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXC8P31273 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXC8P31273 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXC8P31273 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXC8P31273 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXC8P31273 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXC8P31273 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXC8P31273 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXC8P31273 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXC8P31273 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXC8P31273 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXC8P31273 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXC8P31273 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXC8P31273 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXC8P31273 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXC8P31273 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXC8P31273 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXC8P31273 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXC8P31273 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXC8P31273 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXC8P31273 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXC8P31273 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms