Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD40LGP29965 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD40LGP29965 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CD40LGP29965 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD40LGP29965 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD40LGP29965 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD40LGP29965 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CD40LGP29965 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CD40LGP29965 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CD40LGP29965 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CD40LGP29965 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CD40LGP29965 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CD40LGP29965 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CD40LGP29965 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CD40LGP29965 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CD40LGP29965 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CD40LGP29965 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CD40LGP29965 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CD40LGP29965 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CD40LGP29965 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CD40LGP29965 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CD40LGP29965 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD40LGP29965 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD40LGP29965 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD40LGP29965 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD40LGP29965 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD40LGP29965 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD40LGP29965 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD40LGP29965 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD40LGP29965 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD40LGP29965 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD40LGP29965 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD40LGP29965 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD40LGP29965 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD40LGP29965 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD40LGP29965 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD40LGP29965 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD40LGP29965 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD40LGP29965 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD40LGP29965 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD40LGP29965 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD40LGP29965 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD40LGP29965 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD40LGP29965 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD40LGP29965 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD40LGP29965 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD40LGP29965 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD40LGP29965 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD40LGP29965 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD40LGP29965 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CD40LGP29965 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CD40LGP29965 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CD40LGP29965 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CD40LGP29965 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD40LGP29965 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD40LGP29965 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD40LGP29965 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CD40LGP29965 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD40LGP29965 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD40LGP29965 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD40LGP29965 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD40LGP29965 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD40LGP29965 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CD40LGP29965 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CD40LGP29965 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD40LGP29965 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CD40LGP29965 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CD40LGP29965 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CD40LGP29965 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD40LGP29965 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD40LGP29965 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD40LGP29965 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD40LGP29965 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CD40LGP29965 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CD40LGP29965 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD40LGP29965 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD40LGP29965 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD40LGP29965 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD40LGP29965 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD40LGP29965 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD40LGP29965 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD40LGP29965 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD40LGP29965 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CD40LGP29965 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD40LGP29965 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD40LGP29965 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CD40LGP29965 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CD40LGP29965 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD40LGP29965 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD40LGP29965 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD40LGP29965 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD40LGP29965 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD40LGP29965 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD40LGP29965 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD40LGP29965 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD40LGP29965 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD40LGP29965 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD40LGP29965 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD40LGP29965 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD40LGP29965 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms