Protein–RNA interactions for Protein: P29536

LMOD1, Leiomodin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD1P29536 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LMOD1P29536 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LMOD1P29536 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LMOD1P29536 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LMOD1P29536 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LMOD1P29536 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LMOD1P29536 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LMOD1P29536 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LMOD1P29536 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LMOD1P29536 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
LMOD1P29536 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LMOD1P29536 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LMOD1P29536 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LMOD1P29536 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LMOD1P29536 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LMOD1P29536 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LMOD1P29536 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LMOD1P29536 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LMOD1P29536 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LMOD1P29536 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LMOD1P29536 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LMOD1P29536 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LMOD1P29536 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
LMOD1P29536 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LMOD1P29536 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
LMOD1P29536 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
LMOD1P29536 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
LMOD1P29536 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
LMOD1P29536 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LMOD1P29536 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LMOD1P29536 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LMOD1P29536 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LMOD1P29536 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LMOD1P29536 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LMOD1P29536 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMOD1P29536 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMOD1P29536 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMOD1P29536 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMOD1P29536 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMOD1P29536 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMOD1P29536 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMOD1P29536 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMOD1P29536 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMOD1P29536 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMOD1P29536 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMOD1P29536 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMOD1P29536 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMOD1P29536 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMOD1P29536 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMOD1P29536 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMOD1P29536 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMOD1P29536 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMOD1P29536 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LMOD1P29536 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LMOD1P29536 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LMOD1P29536 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LMOD1P29536 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LMOD1P29536 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LMOD1P29536 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LMOD1P29536 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LMOD1P29536 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LMOD1P29536 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LMOD1P29536 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LMOD1P29536 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
LMOD1P29536 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LMOD1P29536 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LMOD1P29536 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LMOD1P29536 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LMOD1P29536 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LMOD1P29536 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LMOD1P29536 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LMOD1P29536 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LMOD1P29536 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LMOD1P29536 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LMOD1P29536 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LMOD1P29536 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LMOD1P29536 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LMOD1P29536 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LMOD1P29536 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LMOD1P29536 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LMOD1P29536 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
LMOD1P29536 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LMOD1P29536 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LMOD1P29536 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LMOD1P29536 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LMOD1P29536 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LMOD1P29536 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LMOD1P29536 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LMOD1P29536 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LMOD1P29536 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LMOD1P29536 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LMOD1P29536 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LMOD1P29536 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LMOD1P29536 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
LMOD1P29536 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
LMOD1P29536 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LMOD1P29536 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LMOD1P29536 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LMOD1P29536 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LMOD1P29536 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms