Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGA3P26006 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGA3P26006 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGA3P26006 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGA3P26006 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGA3P26006 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGA3P26006 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGA3P26006 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGA3P26006 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGA3P26006 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGA3P26006 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGA3P26006 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGA3P26006 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGA3P26006 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGA3P26006 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGA3P26006 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGA3P26006 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGA3P26006 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGA3P26006 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGA3P26006 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGA3P26006 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGA3P26006 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGA3P26006 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGA3P26006 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGA3P26006 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGA3P26006 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGA3P26006 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGA3P26006 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGA3P26006 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGA3P26006 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGA3P26006 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGA3P26006 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGA3P26006 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGA3P26006 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGA3P26006 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGA3P26006 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGA3P26006 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGA3P26006 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGA3P26006 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGA3P26006 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGA3P26006 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGA3P26006 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGA3P26006 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGA3P26006 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGA3P26006 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGA3P26006 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGA3P26006 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGA3P26006 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGA3P26006 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGA3P26006 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGA3P26006 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGA3P26006 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGA3P26006 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGA3P26006 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGA3P26006 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGA3P26006 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGA3P26006 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGA3P26006 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGA3P26006 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGA3P26006 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGA3P26006 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGA3P26006 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGA3P26006 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGA3P26006 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGA3P26006 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGA3P26006 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGA3P26006 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGA3P26006 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGA3P26006 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGA3P26006 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGA3P26006 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGA3P26006 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGA3P26006 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGA3P26006 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGA3P26006 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGA3P26006 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGA3P26006 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGA3P26006 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGA3P26006 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGA3P26006 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGA3P26006 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGA3P26006 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGA3P26006 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGA3P26006 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGA3P26006 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGA3P26006 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGA3P26006 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGA3P26006 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGA3P26006 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGA3P26006 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGA3P26006 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGA3P26006 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGA3P26006 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGA3P26006 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGA3P26006 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGA3P26006 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGA3P26006 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGA3P26006 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGA3P26006 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGA3P26006 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms