Protein–RNA interactions for Protein: P16520

GNB3, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB3P16520 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GNB3P16520 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GNB3P16520 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GNB3P16520 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GNB3P16520 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GNB3P16520 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GNB3P16520 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GNB3P16520 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GNB3P16520 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GNB3P16520 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GNB3P16520 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GNB3P16520 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GNB3P16520 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GNB3P16520 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GNB3P16520 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GNB3P16520 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GNB3P16520 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GNB3P16520 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GNB3P16520 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GNB3P16520 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GNB3P16520 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GNB3P16520 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GNB3P16520 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GNB3P16520 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GNB3P16520 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GNB3P16520 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GNB3P16520 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GNB3P16520 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GNB3P16520 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GNB3P16520 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GNB3P16520 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GNB3P16520 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GNB3P16520 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GNB3P16520 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GNB3P16520 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GNB3P16520 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GNB3P16520 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GNB3P16520 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GNB3P16520 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GNB3P16520 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GNB3P16520 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GNB3P16520 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GNB3P16520 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GNB3P16520 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GNB3P16520 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GNB3P16520 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GNB3P16520 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GNB3P16520 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GNB3P16520 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GNB3P16520 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GNB3P16520 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GNB3P16520 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GNB3P16520 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GNB3P16520 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GNB3P16520 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GNB3P16520 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GNB3P16520 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GNB3P16520 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GNB3P16520 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GNB3P16520 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GNB3P16520 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GNB3P16520 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GNB3P16520 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GNB3P16520 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GNB3P16520 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GNB3P16520 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GNB3P16520 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GNB3P16520 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GNB3P16520 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GNB3P16520 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GNB3P16520 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GNB3P16520 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GNB3P16520 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GNB3P16520 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GNB3P16520 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GNB3P16520 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GNB3P16520 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GNB3P16520 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GNB3P16520 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GNB3P16520 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GNB3P16520 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GNB3P16520 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GNB3P16520 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GNB3P16520 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GNB3P16520 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GNB3P16520 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GNB3P16520 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GNB3P16520 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GNB3P16520 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GNB3P16520 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GNB3P16520 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GNB3P16520 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GNB3P16520 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GNB3P16520 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GNB3P16520 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GNB3P16520 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GNB3P16520 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GNB3P16520 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GNB3P16520 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GNB3P16520 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms