Protein–RNA interactions for Protein: P14678

SNRPB, Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B', humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPBP14678 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNRPBP14678 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNRPBP14678 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNRPBP14678 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNRPBP14678 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNRPBP14678 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNRPBP14678 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNRPBP14678 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNRPBP14678 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SNRPBP14678 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNRPBP14678 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNRPBP14678 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNRPBP14678 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNRPBP14678 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNRPBP14678 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNRPBP14678 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNRPBP14678 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNRPBP14678 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNRPBP14678 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNRPBP14678 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNRPBP14678 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNRPBP14678 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNRPBP14678 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNRPBP14678 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNRPBP14678 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNRPBP14678 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNRPBP14678 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNRPBP14678 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNRPBP14678 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNRPBP14678 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNRPBP14678 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SNRPBP14678 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNRPBP14678 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNRPBP14678 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNRPBP14678 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNRPBP14678 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNRPBP14678 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNRPBP14678 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNRPBP14678 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNRPBP14678 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNRPBP14678 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNRPBP14678 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNRPBP14678 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNRPBP14678 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNRPBP14678 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNRPBP14678 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNRPBP14678 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNRPBP14678 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNRPBP14678 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNRPBP14678 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNRPBP14678 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNRPBP14678 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNRPBP14678 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNRPBP14678 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNRPBP14678 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNRPBP14678 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNRPBP14678 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNRPBP14678 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNRPBP14678 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNRPBP14678 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNRPBP14678 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNRPBP14678 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNRPBP14678 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNRPBP14678 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNRPBP14678 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNRPBP14678 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNRPBP14678 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNRPBP14678 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNRPBP14678 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SNRPBP14678 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNRPBP14678 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNRPBP14678 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNRPBP14678 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNRPBP14678 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNRPBP14678 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNRPBP14678 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNRPBP14678 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNRPBP14678 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNRPBP14678 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNRPBP14678 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNRPBP14678 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNRPBP14678 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNRPBP14678 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNRPBP14678 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNRPBP14678 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNRPBP14678 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNRPBP14678 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNRPBP14678 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNRPBP14678 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNRPBP14678 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNRPBP14678 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SNRPBP14678 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNRPBP14678 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNRPBP14678 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNRPBP14678 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNRPBP14678 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNRPBP14678 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNRPBP14678 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNRPBP14678 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNRPBP14678 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms