Protein–RNA interactions for Protein: P11836

MS4A1, B-lymphocyte antigen CD20, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A1P11836 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
MS4A1P11836 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
MS4A1P11836 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
MS4A1P11836 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
MS4A1P11836 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
MS4A1P11836 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
MS4A1P11836 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
MS4A1P11836 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MS4A1P11836 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MS4A1P11836 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MS4A1P11836 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MS4A1P11836 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MS4A1P11836 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MS4A1P11836 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MS4A1P11836 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MS4A1P11836 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MS4A1P11836 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MS4A1P11836 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MS4A1P11836 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MS4A1P11836 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MS4A1P11836 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MS4A1P11836 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MS4A1P11836 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MS4A1P11836 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MS4A1P11836 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MS4A1P11836 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MS4A1P11836 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MS4A1P11836 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MS4A1P11836 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MS4A1P11836 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MS4A1P11836 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
MS4A1P11836 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MS4A1P11836 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MS4A1P11836 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MS4A1P11836 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MS4A1P11836 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MS4A1P11836 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MS4A1P11836 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MS4A1P11836 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MS4A1P11836 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MS4A1P11836 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MS4A1P11836 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MS4A1P11836 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MS4A1P11836 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MS4A1P11836 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MS4A1P11836 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MS4A1P11836 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MS4A1P11836 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MS4A1P11836 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MS4A1P11836 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MS4A1P11836 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MS4A1P11836 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MS4A1P11836 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MS4A1P11836 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
MS4A1P11836 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MS4A1P11836 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MS4A1P11836 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MS4A1P11836 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MS4A1P11836 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MS4A1P11836 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MS4A1P11836 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MS4A1P11836 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MS4A1P11836 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MS4A1P11836 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MS4A1P11836 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MS4A1P11836 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MS4A1P11836 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MS4A1P11836 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MS4A1P11836 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MS4A1P11836 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MS4A1P11836 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
MS4A1P11836 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MS4A1P11836 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MS4A1P11836 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MS4A1P11836 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MS4A1P11836 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MS4A1P11836 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MS4A1P11836 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MS4A1P11836 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MS4A1P11836 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MS4A1P11836 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MS4A1P11836 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
MS4A1P11836 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MS4A1P11836 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MS4A1P11836 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MS4A1P11836 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MS4A1P11836 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MS4A1P11836 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MS4A1P11836 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
MS4A1P11836 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
MS4A1P11836 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MS4A1P11836 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
MS4A1P11836 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MS4A1P11836 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MS4A1P11836 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MS4A1P11836 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
MS4A1P11836 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MS4A1P11836 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MS4A1P11836 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MS4A1P11836 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms