Protein–RNA interactions for Protein: O75808

CAPN15, Calpain-15, humanhuman

Predictions only

Length 1,086 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN15O75808 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAPN15O75808 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAPN15O75808 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAPN15O75808 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAPN15O75808 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAPN15O75808 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAPN15O75808 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAPN15O75808 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAPN15O75808 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAPN15O75808 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CAPN15O75808 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAPN15O75808 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAPN15O75808 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAPN15O75808 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAPN15O75808 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAPN15O75808 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAPN15O75808 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPN15O75808 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPN15O75808 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPN15O75808 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPN15O75808 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPN15O75808 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPN15O75808 LINC00972-202ENST00000438065 788 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPN15O75808 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPN15O75808 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPN15O75808 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPN15O75808 AC084024.3-201ENST00000520598 562 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPN15O75808 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPN15O75808 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPN15O75808 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPN15O75808 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPN15O75808 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPN15O75808 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPN15O75808 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPN15O75808 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPN15O75808 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPN15O75808 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAPN15O75808 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAPN15O75808 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAPN15O75808 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAPN15O75808 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAPN15O75808 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CAPN15O75808 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CAPN15O75808 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CAPN15O75808 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAPN15O75808 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAPN15O75808 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAPN15O75808 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAPN15O75808 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAPN15O75808 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAPN15O75808 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAPN15O75808 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAPN15O75808 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CAPN15O75808 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAPN15O75808 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAPN15O75808 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAPN15O75808 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAPN15O75808 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAPN15O75808 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAPN15O75808 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAPN15O75808 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAPN15O75808 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAPN15O75808 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAPN15O75808 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CAPN15O75808 CFLAR-225ENST00000494258 693 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAPN15O75808 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAPN15O75808 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAPN15O75808 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAPN15O75808 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAPN15O75808 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CAPN15O75808 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAPN15O75808 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAPN15O75808 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAPN15O75808 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAPN15O75808 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAPN15O75808 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CAPN15O75808 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAPN15O75808 KCNQ5-IT1-201ENST00000445310 563 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAPN15O75808 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAPN15O75808 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CAPN15O75808 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAPN15O75808 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAPN15O75808 RPL23A-204ENST00000422514 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPN15O75808 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPN15O75808 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPN15O75808 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPN15O75808 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPN15O75808 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPN15O75808 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPN15O75808 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPN15O75808 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPN15O75808 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPN15O75808 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPN15O75808 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPN15O75808 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPN15O75808 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPN15O75808 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPN15O75808 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPN15O75808 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPN15O75808 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms