Protein–RNA interactions for Protein: O43813

LANCL1, LanC-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LANCL1O43813 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LANCL1O43813 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LANCL1O43813 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LANCL1O43813 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LANCL1O43813 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LANCL1O43813 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LANCL1O43813 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LANCL1O43813 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LANCL1O43813 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LANCL1O43813 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LANCL1O43813 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LANCL1O43813 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LANCL1O43813 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LANCL1O43813 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LANCL1O43813 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LANCL1O43813 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LANCL1O43813 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LANCL1O43813 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
LANCL1O43813 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LANCL1O43813 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LANCL1O43813 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LANCL1O43813 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LANCL1O43813 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LANCL1O43813 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LANCL1O43813 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LANCL1O43813 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LANCL1O43813 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LANCL1O43813 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LANCL1O43813 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LANCL1O43813 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LANCL1O43813 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LANCL1O43813 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LANCL1O43813 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LANCL1O43813 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LANCL1O43813 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LANCL1O43813 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LANCL1O43813 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LANCL1O43813 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LANCL1O43813 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LANCL1O43813 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
LANCL1O43813 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LANCL1O43813 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LANCL1O43813 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LANCL1O43813 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
LANCL1O43813 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LANCL1O43813 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LANCL1O43813 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LANCL1O43813 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LANCL1O43813 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LANCL1O43813 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LANCL1O43813 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LANCL1O43813 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LANCL1O43813 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LANCL1O43813 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LANCL1O43813 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LANCL1O43813 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LANCL1O43813 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LANCL1O43813 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LANCL1O43813 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LANCL1O43813 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LANCL1O43813 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
LANCL1O43813 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LANCL1O43813 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
LANCL1O43813 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LANCL1O43813 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LANCL1O43813 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LANCL1O43813 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LANCL1O43813 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LANCL1O43813 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LANCL1O43813 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LANCL1O43813 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LANCL1O43813 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LANCL1O43813 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LANCL1O43813 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LANCL1O43813 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LANCL1O43813 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LANCL1O43813 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
LANCL1O43813 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LANCL1O43813 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LANCL1O43813 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LANCL1O43813 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LANCL1O43813 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LANCL1O43813 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LANCL1O43813 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LANCL1O43813 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LANCL1O43813 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LANCL1O43813 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LANCL1O43813 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LANCL1O43813 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LANCL1O43813 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LANCL1O43813 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LANCL1O43813 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LANCL1O43813 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LANCL1O43813 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LANCL1O43813 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
LANCL1O43813 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LANCL1O43813 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LANCL1O43813 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LANCL1O43813 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LANCL1O43813 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms