Protein–RNA interactions for Protein: H7C0C1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C0C1 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
H7C0C1 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
H7C0C1 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
H7C0C1 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
H7C0C1 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
H7C0C1 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
H7C0C1 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
H7C0C1 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
H7C0C1 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
H7C0C1 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
H7C0C1 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
H7C0C1 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
H7C0C1 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
H7C0C1 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
H7C0C1 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
H7C0C1 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
H7C0C1 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
H7C0C1 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
H7C0C1 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
H7C0C1 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
H7C0C1 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
H7C0C1 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
H7C0C1 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
H7C0C1 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
H7C0C1 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
H7C0C1 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
H7C0C1 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
H7C0C1 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
H7C0C1 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
H7C0C1 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
H7C0C1 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
H7C0C1 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
H7C0C1 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
H7C0C1 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
H7C0C1 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
H7C0C1 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
H7C0C1 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
H7C0C1 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
H7C0C1 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
H7C0C1 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
H7C0C1 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
H7C0C1 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
H7C0C1 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
H7C0C1 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
H7C0C1 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
H7C0C1 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
H7C0C1 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
H7C0C1 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
H7C0C1 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
H7C0C1 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
H7C0C1 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
H7C0C1 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
H7C0C1 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
H7C0C1 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
H7C0C1 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
H7C0C1 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
H7C0C1 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
H7C0C1 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
H7C0C1 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
H7C0C1 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
H7C0C1 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
H7C0C1 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
H7C0C1 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
H7C0C1 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
H7C0C1 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
H7C0C1 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
H7C0C1 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
H7C0C1 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
H7C0C1 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
H7C0C1 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
H7C0C1 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
H7C0C1 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
H7C0C1 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
H7C0C1 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21■□□□□ 0.95
H7C0C1 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
H7C0C1 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
H7C0C1 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21■□□□□ 0.95
H7C0C1 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
H7C0C1 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
H7C0C1 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
H7C0C1 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
H7C0C1 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
H7C0C1 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
H7C0C1 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
H7C0C1 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
H7C0C1 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
H7C0C1 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
H7C0C1 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
H7C0C1 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
H7C0C1 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
H7C0C1 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
H7C0C1 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
H7C0C1 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
H7C0C1 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
H7C0C1 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
H7C0C1 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
H7C0C1 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
H7C0C1 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
H7C0C1 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
H7C0C1 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms