Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NOTOA8MTQ0 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NOTOA8MTQ0 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NOTOA8MTQ0 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NOTOA8MTQ0 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NOTOA8MTQ0 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NOTOA8MTQ0 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NOTOA8MTQ0 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NOTOA8MTQ0 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NOTOA8MTQ0 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NOTOA8MTQ0 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NOTOA8MTQ0 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NOTOA8MTQ0 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NOTOA8MTQ0 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NOTOA8MTQ0 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NOTOA8MTQ0 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NOTOA8MTQ0 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NOTOA8MTQ0 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NOTOA8MTQ0 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NOTOA8MTQ0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NOTOA8MTQ0 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NOTOA8MTQ0 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NOTOA8MTQ0 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NOTOA8MTQ0 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NOTOA8MTQ0 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NOTOA8MTQ0 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NOTOA8MTQ0 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
NOTOA8MTQ0 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NOTOA8MTQ0 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NOTOA8MTQ0 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NOTOA8MTQ0 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NOTOA8MTQ0 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NOTOA8MTQ0 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NOTOA8MTQ0 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NOTOA8MTQ0 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NOTOA8MTQ0 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NOTOA8MTQ0 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NOTOA8MTQ0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NOTOA8MTQ0 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NOTOA8MTQ0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NOTOA8MTQ0 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NOTOA8MTQ0 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NOTOA8MTQ0 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NOTOA8MTQ0 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NOTOA8MTQ0 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NOTOA8MTQ0 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NOTOA8MTQ0 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NOTOA8MTQ0 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
NOTOA8MTQ0 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
NOTOA8MTQ0 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
NOTOA8MTQ0 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NOTOA8MTQ0 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NOTOA8MTQ0 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NOTOA8MTQ0 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NOTOA8MTQ0 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NOTOA8MTQ0 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NOTOA8MTQ0 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NOTOA8MTQ0 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NOTOA8MTQ0 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NOTOA8MTQ0 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NOTOA8MTQ0 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NOTOA8MTQ0 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NOTOA8MTQ0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NOTOA8MTQ0 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NOTOA8MTQ0 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NOTOA8MTQ0 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NOTOA8MTQ0 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
NOTOA8MTQ0 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NOTOA8MTQ0 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NOTOA8MTQ0 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NOTOA8MTQ0 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NOTOA8MTQ0 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NOTOA8MTQ0 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NOTOA8MTQ0 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NOTOA8MTQ0 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NOTOA8MTQ0 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NOTOA8MTQ0 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NOTOA8MTQ0 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NOTOA8MTQ0 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NOTOA8MTQ0 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NOTOA8MTQ0 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NOTOA8MTQ0 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NOTOA8MTQ0 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NOTOA8MTQ0 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NOTOA8MTQ0 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NOTOA8MTQ0 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NOTOA8MTQ0 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NOTOA8MTQ0 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NOTOA8MTQ0 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NOTOA8MTQ0 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NOTOA8MTQ0 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NOTOA8MTQ0 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NOTOA8MTQ0 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NOTOA8MTQ0 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NOTOA8MTQ0 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NOTOA8MTQ0 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NOTOA8MTQ0 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NOTOA8MTQ0 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NOTOA8MTQ0 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NOTOA8MTQ0 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms