Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2S0

POLR1D, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC2, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1DQ9Y2S0 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR1DQ9Y2S0 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR1DQ9Y2S0 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR1DQ9Y2S0 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR1DQ9Y2S0 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR1DQ9Y2S0 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR1DQ9Y2S0 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR1DQ9Y2S0 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR1DQ9Y2S0 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR1DQ9Y2S0 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR1DQ9Y2S0 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR1DQ9Y2S0 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR1DQ9Y2S0 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR1DQ9Y2S0 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR1DQ9Y2S0 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR1DQ9Y2S0 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR1DQ9Y2S0 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR1DQ9Y2S0 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR1DQ9Y2S0 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR1DQ9Y2S0 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR1DQ9Y2S0 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR1DQ9Y2S0 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR1DQ9Y2S0 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR1DQ9Y2S0 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR1DQ9Y2S0 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR1DQ9Y2S0 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR1DQ9Y2S0 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR1DQ9Y2S0 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR1DQ9Y2S0 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR1DQ9Y2S0 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR1DQ9Y2S0 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR1DQ9Y2S0 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR1DQ9Y2S0 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR1DQ9Y2S0 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR1DQ9Y2S0 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR1DQ9Y2S0 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR1DQ9Y2S0 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR1DQ9Y2S0 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR1DQ9Y2S0 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR1DQ9Y2S0 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR1DQ9Y2S0 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR1DQ9Y2S0 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR1DQ9Y2S0 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR1DQ9Y2S0 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR1DQ9Y2S0 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR1DQ9Y2S0 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR1DQ9Y2S0 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR1DQ9Y2S0 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR1DQ9Y2S0 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR1DQ9Y2S0 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR1DQ9Y2S0 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR1DQ9Y2S0 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR1DQ9Y2S0 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR1DQ9Y2S0 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR1DQ9Y2S0 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR1DQ9Y2S0 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR1DQ9Y2S0 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR1DQ9Y2S0 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR1DQ9Y2S0 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR1DQ9Y2S0 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR1DQ9Y2S0 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR1DQ9Y2S0 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR1DQ9Y2S0 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR1DQ9Y2S0 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR1DQ9Y2S0 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR1DQ9Y2S0 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR1DQ9Y2S0 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR1DQ9Y2S0 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR1DQ9Y2S0 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR1DQ9Y2S0 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR1DQ9Y2S0 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR1DQ9Y2S0 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR1DQ9Y2S0 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR1DQ9Y2S0 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR1DQ9Y2S0 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR1DQ9Y2S0 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR1DQ9Y2S0 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR1DQ9Y2S0 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR1DQ9Y2S0 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR1DQ9Y2S0 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR1DQ9Y2S0 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR1DQ9Y2S0 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR1DQ9Y2S0 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR1DQ9Y2S0 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR1DQ9Y2S0 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR1DQ9Y2S0 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR1DQ9Y2S0 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR1DQ9Y2S0 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR1DQ9Y2S0 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR1DQ9Y2S0 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR1DQ9Y2S0 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR1DQ9Y2S0 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR1DQ9Y2S0 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR1DQ9Y2S0 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR1DQ9Y2S0 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR1DQ9Y2S0 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR1DQ9Y2S0 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR1DQ9Y2S0 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
POLR1DQ9Y2S0 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
POLR1DQ9Y2S0 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms