Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULV3

CIZ1, Cip1-interacting zinc finger protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 898 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIZ1Q9ULV3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CIZ1Q9ULV3 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CIZ1Q9ULV3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CIZ1Q9ULV3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CIZ1Q9ULV3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CIZ1Q9ULV3 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CIZ1Q9ULV3 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CIZ1Q9ULV3 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CIZ1Q9ULV3 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CIZ1Q9ULV3 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CIZ1Q9ULV3 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CIZ1Q9ULV3 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CIZ1Q9ULV3 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CIZ1Q9ULV3 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CIZ1Q9ULV3 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CIZ1Q9ULV3 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CIZ1Q9ULV3 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CIZ1Q9ULV3 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CIZ1Q9ULV3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CIZ1Q9ULV3 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CIZ1Q9ULV3 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CIZ1Q9ULV3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CIZ1Q9ULV3 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CIZ1Q9ULV3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CIZ1Q9ULV3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CIZ1Q9ULV3 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CIZ1Q9ULV3 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CIZ1Q9ULV3 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CIZ1Q9ULV3 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CIZ1Q9ULV3 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CIZ1Q9ULV3 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CIZ1Q9ULV3 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CIZ1Q9ULV3 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CIZ1Q9ULV3 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CIZ1Q9ULV3 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CIZ1Q9ULV3 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CIZ1Q9ULV3 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CIZ1Q9ULV3 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CIZ1Q9ULV3 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CIZ1Q9ULV3 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CIZ1Q9ULV3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CIZ1Q9ULV3 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CIZ1Q9ULV3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CIZ1Q9ULV3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CIZ1Q9ULV3 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CIZ1Q9ULV3 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CIZ1Q9ULV3 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CIZ1Q9ULV3 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CIZ1Q9ULV3 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CIZ1Q9ULV3 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CIZ1Q9ULV3 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CIZ1Q9ULV3 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CIZ1Q9ULV3 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CIZ1Q9ULV3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CIZ1Q9ULV3 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CIZ1Q9ULV3 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CIZ1Q9ULV3 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CIZ1Q9ULV3 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CIZ1Q9ULV3 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CIZ1Q9ULV3 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CIZ1Q9ULV3 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CIZ1Q9ULV3 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CIZ1Q9ULV3 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CIZ1Q9ULV3 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CIZ1Q9ULV3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CIZ1Q9ULV3 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CIZ1Q9ULV3 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CIZ1Q9ULV3 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CIZ1Q9ULV3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CIZ1Q9ULV3 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CIZ1Q9ULV3 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CIZ1Q9ULV3 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CIZ1Q9ULV3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CIZ1Q9ULV3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CIZ1Q9ULV3 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CIZ1Q9ULV3 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CIZ1Q9ULV3 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CIZ1Q9ULV3 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CIZ1Q9ULV3 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CIZ1Q9ULV3 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CIZ1Q9ULV3 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CIZ1Q9ULV3 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CIZ1Q9ULV3 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CIZ1Q9ULV3 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CIZ1Q9ULV3 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CIZ1Q9ULV3 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CIZ1Q9ULV3 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CIZ1Q9ULV3 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CIZ1Q9ULV3 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CIZ1Q9ULV3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CIZ1Q9ULV3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CIZ1Q9ULV3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CIZ1Q9ULV3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CIZ1Q9ULV3 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CIZ1Q9ULV3 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CIZ1Q9ULV3 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CIZ1Q9ULV3 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CIZ1Q9ULV3 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CIZ1Q9ULV3 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CIZ1Q9ULV3 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms