Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL3

CASP8AP2, CASP8-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,982 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP8AP2Q9UKL3 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CASP8AP2Q9UKL3 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CASP8AP2Q9UKL3 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CASP8AP2Q9UKL3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CASP8AP2Q9UKL3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CASP8AP2Q9UKL3 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CASP8AP2Q9UKL3 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CASP8AP2Q9UKL3 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CASP8AP2Q9UKL3 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CASP8AP2Q9UKL3 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CASP8AP2Q9UKL3 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CASP8AP2Q9UKL3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CASP8AP2Q9UKL3 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CASP8AP2Q9UKL3 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CASP8AP2Q9UKL3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CASP8AP2Q9UKL3 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CASP8AP2Q9UKL3 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CASP8AP2Q9UKL3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CASP8AP2Q9UKL3 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CASP8AP2Q9UKL3 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CASP8AP2Q9UKL3 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CASP8AP2Q9UKL3 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CASP8AP2Q9UKL3 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CASP8AP2Q9UKL3 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CASP8AP2Q9UKL3 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CASP8AP2Q9UKL3 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CASP8AP2Q9UKL3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CASP8AP2Q9UKL3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CASP8AP2Q9UKL3 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CASP8AP2Q9UKL3 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CASP8AP2Q9UKL3 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CASP8AP2Q9UKL3 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CASP8AP2Q9UKL3 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CASP8AP2Q9UKL3 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CASP8AP2Q9UKL3 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CASP8AP2Q9UKL3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CASP8AP2Q9UKL3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CASP8AP2Q9UKL3 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CASP8AP2Q9UKL3 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASP8AP2Q9UKL3 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASP8AP2Q9UKL3 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASP8AP2Q9UKL3 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASP8AP2Q9UKL3 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASP8AP2Q9UKL3 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASP8AP2Q9UKL3 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASP8AP2Q9UKL3 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASP8AP2Q9UKL3 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASP8AP2Q9UKL3 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASP8AP2Q9UKL3 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASP8AP2Q9UKL3 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASP8AP2Q9UKL3 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASP8AP2Q9UKL3 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASP8AP2Q9UKL3 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CASP8AP2Q9UKL3 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CASP8AP2Q9UKL3 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CASP8AP2Q9UKL3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CASP8AP2Q9UKL3 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CASP8AP2Q9UKL3 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CASP8AP2Q9UKL3 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CASP8AP2Q9UKL3 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CASP8AP2Q9UKL3 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CASP8AP2Q9UKL3 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CASP8AP2Q9UKL3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CASP8AP2Q9UKL3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CASP8AP2Q9UKL3 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CASP8AP2Q9UKL3 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CASP8AP2Q9UKL3 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CASP8AP2Q9UKL3 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASP8AP2Q9UKL3 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASP8AP2Q9UKL3 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASP8AP2Q9UKL3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASP8AP2Q9UKL3 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASP8AP2Q9UKL3 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASP8AP2Q9UKL3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASP8AP2Q9UKL3 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASP8AP2Q9UKL3 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CASP8AP2Q9UKL3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASP8AP2Q9UKL3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASP8AP2Q9UKL3 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASP8AP2Q9UKL3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASP8AP2Q9UKL3 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASP8AP2Q9UKL3 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASP8AP2Q9UKL3 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASP8AP2Q9UKL3 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASP8AP2Q9UKL3 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASP8AP2Q9UKL3 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASP8AP2Q9UKL3 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASP8AP2Q9UKL3 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASP8AP2Q9UKL3 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASP8AP2Q9UKL3 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASP8AP2Q9UKL3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASP8AP2Q9UKL3 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CASP8AP2Q9UKL3 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CASP8AP2Q9UKL3 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CASP8AP2Q9UKL3 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CASP8AP2Q9UKL3 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CASP8AP2Q9UKL3 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CASP8AP2Q9UKL3 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CASP8AP2Q9UKL3 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CASP8AP2Q9UKL3 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms