Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH9

TRMT1, tRNA (guanine(26)-N(2))-dimethyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT1Q9NXH9 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRMT1Q9NXH9 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRMT1Q9NXH9 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRMT1Q9NXH9 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRMT1Q9NXH9 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRMT1Q9NXH9 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRMT1Q9NXH9 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRMT1Q9NXH9 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRMT1Q9NXH9 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRMT1Q9NXH9 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRMT1Q9NXH9 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRMT1Q9NXH9 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TRMT1Q9NXH9 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRMT1Q9NXH9 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRMT1Q9NXH9 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRMT1Q9NXH9 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRMT1Q9NXH9 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRMT1Q9NXH9 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRMT1Q9NXH9 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRMT1Q9NXH9 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRMT1Q9NXH9 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRMT1Q9NXH9 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRMT1Q9NXH9 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRMT1Q9NXH9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRMT1Q9NXH9 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRMT1Q9NXH9 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRMT1Q9NXH9 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRMT1Q9NXH9 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRMT1Q9NXH9 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRMT1Q9NXH9 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRMT1Q9NXH9 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRMT1Q9NXH9 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRMT1Q9NXH9 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRMT1Q9NXH9 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRMT1Q9NXH9 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRMT1Q9NXH9 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRMT1Q9NXH9 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRMT1Q9NXH9 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRMT1Q9NXH9 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRMT1Q9NXH9 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRMT1Q9NXH9 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRMT1Q9NXH9 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRMT1Q9NXH9 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRMT1Q9NXH9 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRMT1Q9NXH9 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRMT1Q9NXH9 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRMT1Q9NXH9 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRMT1Q9NXH9 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRMT1Q9NXH9 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRMT1Q9NXH9 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRMT1Q9NXH9 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRMT1Q9NXH9 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRMT1Q9NXH9 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRMT1Q9NXH9 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRMT1Q9NXH9 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRMT1Q9NXH9 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRMT1Q9NXH9 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TRMT1Q9NXH9 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRMT1Q9NXH9 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRMT1Q9NXH9 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRMT1Q9NXH9 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRMT1Q9NXH9 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRMT1Q9NXH9 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRMT1Q9NXH9 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRMT1Q9NXH9 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRMT1Q9NXH9 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRMT1Q9NXH9 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRMT1Q9NXH9 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRMT1Q9NXH9 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRMT1Q9NXH9 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRMT1Q9NXH9 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRMT1Q9NXH9 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TRMT1Q9NXH9 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRMT1Q9NXH9 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRMT1Q9NXH9 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TRMT1Q9NXH9 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRMT1Q9NXH9 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRMT1Q9NXH9 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRMT1Q9NXH9 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRMT1Q9NXH9 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRMT1Q9NXH9 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TRMT1Q9NXH9 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRMT1Q9NXH9 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRMT1Q9NXH9 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRMT1Q9NXH9 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRMT1Q9NXH9 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRMT1Q9NXH9 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRMT1Q9NXH9 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRMT1Q9NXH9 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRMT1Q9NXH9 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRMT1Q9NXH9 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRMT1Q9NXH9 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRMT1Q9NXH9 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRMT1Q9NXH9 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRMT1Q9NXH9 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRMT1Q9NXH9 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRMT1Q9NXH9 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRMT1Q9NXH9 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRMT1Q9NXH9 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRMT1Q9NXH9 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms