Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZC1

CELF4, CUGBP Elav-like family member 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF4Q9BZC1 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CELF4Q9BZC1 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CELF4Q9BZC1 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CELF4Q9BZC1 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CELF4Q9BZC1 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CELF4Q9BZC1 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CELF4Q9BZC1 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CELF4Q9BZC1 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CELF4Q9BZC1 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CELF4Q9BZC1 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CELF4Q9BZC1 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CELF4Q9BZC1 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CELF4Q9BZC1 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CELF4Q9BZC1 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CELF4Q9BZC1 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CELF4Q9BZC1 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CELF4Q9BZC1 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CELF4Q9BZC1 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CELF4Q9BZC1 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CELF4Q9BZC1 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CELF4Q9BZC1 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CELF4Q9BZC1 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CELF4Q9BZC1 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CELF4Q9BZC1 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CELF4Q9BZC1 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CELF4Q9BZC1 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CELF4Q9BZC1 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CELF4Q9BZC1 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CELF4Q9BZC1 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CELF4Q9BZC1 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CELF4Q9BZC1 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CELF4Q9BZC1 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CELF4Q9BZC1 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CELF4Q9BZC1 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CELF4Q9BZC1 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CELF4Q9BZC1 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CELF4Q9BZC1 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CELF4Q9BZC1 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CELF4Q9BZC1 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CELF4Q9BZC1 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CELF4Q9BZC1 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CELF4Q9BZC1 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CELF4Q9BZC1 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CELF4Q9BZC1 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CELF4Q9BZC1 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CELF4Q9BZC1 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CELF4Q9BZC1 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CELF4Q9BZC1 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CELF4Q9BZC1 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CELF4Q9BZC1 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CELF4Q9BZC1 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CELF4Q9BZC1 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CELF4Q9BZC1 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CELF4Q9BZC1 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CELF4Q9BZC1 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CELF4Q9BZC1 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CELF4Q9BZC1 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CELF4Q9BZC1 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CELF4Q9BZC1 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CELF4Q9BZC1 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CELF4Q9BZC1 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CELF4Q9BZC1 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CELF4Q9BZC1 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CELF4Q9BZC1 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CELF4Q9BZC1 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CELF4Q9BZC1 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CELF4Q9BZC1 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CELF4Q9BZC1 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CELF4Q9BZC1 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CELF4Q9BZC1 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CELF4Q9BZC1 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CELF4Q9BZC1 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CELF4Q9BZC1 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CELF4Q9BZC1 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CELF4Q9BZC1 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CELF4Q9BZC1 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CELF4Q9BZC1 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CELF4Q9BZC1 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CELF4Q9BZC1 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CELF4Q9BZC1 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CELF4Q9BZC1 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CELF4Q9BZC1 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CELF4Q9BZC1 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CELF4Q9BZC1 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CELF4Q9BZC1 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CELF4Q9BZC1 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CELF4Q9BZC1 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CELF4Q9BZC1 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CELF4Q9BZC1 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CELF4Q9BZC1 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CELF4Q9BZC1 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CELF4Q9BZC1 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CELF4Q9BZC1 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CELF4Q9BZC1 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CELF4Q9BZC1 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CELF4Q9BZC1 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CELF4Q9BZC1 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CELF4Q9BZC1 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CELF4Q9BZC1 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CELF4Q9BZC1 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms