Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU61

NDUFAF3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAF3Q9BU61 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NDUFAF3Q9BU61 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NDUFAF3Q9BU61 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NDUFAF3Q9BU61 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NDUFAF3Q9BU61 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NDUFAF3Q9BU61 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
NDUFAF3Q9BU61 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NDUFAF3Q9BU61 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NDUFAF3Q9BU61 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NDUFAF3Q9BU61 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NDUFAF3Q9BU61 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NDUFAF3Q9BU61 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NDUFAF3Q9BU61 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
NDUFAF3Q9BU61 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NDUFAF3Q9BU61 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NDUFAF3Q9BU61 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NDUFAF3Q9BU61 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NDUFAF3Q9BU61 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NDUFAF3Q9BU61 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NDUFAF3Q9BU61 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
NDUFAF3Q9BU61 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NDUFAF3Q9BU61 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
NDUFAF3Q9BU61 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NDUFAF3Q9BU61 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NDUFAF3Q9BU61 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NDUFAF3Q9BU61 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NDUFAF3Q9BU61 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NDUFAF3Q9BU61 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NDUFAF3Q9BU61 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NDUFAF3Q9BU61 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NDUFAF3Q9BU61 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NDUFAF3Q9BU61 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NDUFAF3Q9BU61 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NDUFAF3Q9BU61 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NDUFAF3Q9BU61 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NDUFAF3Q9BU61 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NDUFAF3Q9BU61 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NDUFAF3Q9BU61 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NDUFAF3Q9BU61 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NDUFAF3Q9BU61 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NDUFAF3Q9BU61 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NDUFAF3Q9BU61 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NDUFAF3Q9BU61 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
NDUFAF3Q9BU61 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NDUFAF3Q9BU61 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NDUFAF3Q9BU61 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NDUFAF3Q9BU61 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NDUFAF3Q9BU61 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NDUFAF3Q9BU61 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NDUFAF3Q9BU61 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NDUFAF3Q9BU61 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NDUFAF3Q9BU61 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NDUFAF3Q9BU61 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NDUFAF3Q9BU61 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NDUFAF3Q9BU61 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NDUFAF3Q9BU61 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NDUFAF3Q9BU61 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NDUFAF3Q9BU61 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.6 ms