Protein–RNA interactions for Protein: Q96PP9

GBP4, Guanylate-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP4Q96PP9 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GBP4Q96PP9 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GBP4Q96PP9 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
GBP4Q96PP9 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
GBP4Q96PP9 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GBP4Q96PP9 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GBP4Q96PP9 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GBP4Q96PP9 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GBP4Q96PP9 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GBP4Q96PP9 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GBP4Q96PP9 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GBP4Q96PP9 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GBP4Q96PP9 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GBP4Q96PP9 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GBP4Q96PP9 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GBP4Q96PP9 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GBP4Q96PP9 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GBP4Q96PP9 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GBP4Q96PP9 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GBP4Q96PP9 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GBP4Q96PP9 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GBP4Q96PP9 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GBP4Q96PP9 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
GBP4Q96PP9 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GBP4Q96PP9 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GBP4Q96PP9 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GBP4Q96PP9 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GBP4Q96PP9 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GBP4Q96PP9 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GBP4Q96PP9 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GBP4Q96PP9 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
GBP4Q96PP9 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GBP4Q96PP9 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GBP4Q96PP9 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GBP4Q96PP9 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GBP4Q96PP9 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GBP4Q96PP9 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GBP4Q96PP9 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GBP4Q96PP9 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GBP4Q96PP9 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GBP4Q96PP9 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GBP4Q96PP9 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GBP4Q96PP9 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GBP4Q96PP9 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GBP4Q96PP9 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GBP4Q96PP9 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
GBP4Q96PP9 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GBP4Q96PP9 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GBP4Q96PP9 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GBP4Q96PP9 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GBP4Q96PP9 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GBP4Q96PP9 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GBP4Q96PP9 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GBP4Q96PP9 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GBP4Q96PP9 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
GBP4Q96PP9 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GBP4Q96PP9 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GBP4Q96PP9 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GBP4Q96PP9 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
GBP4Q96PP9 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
GBP4Q96PP9 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
GBP4Q96PP9 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
GBP4Q96PP9 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GBP4Q96PP9 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GBP4Q96PP9 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GBP4Q96PP9 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GBP4Q96PP9 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GBP4Q96PP9 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GBP4Q96PP9 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GBP4Q96PP9 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GBP4Q96PP9 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GBP4Q96PP9 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GBP4Q96PP9 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GBP4Q96PP9 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GBP4Q96PP9 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GBP4Q96PP9 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GBP4Q96PP9 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GBP4Q96PP9 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GBP4Q96PP9 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GBP4Q96PP9 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GBP4Q96PP9 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GBP4Q96PP9 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GBP4Q96PP9 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GBP4Q96PP9 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GBP4Q96PP9 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GBP4Q96PP9 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GBP4Q96PP9 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GBP4Q96PP9 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
GBP4Q96PP9 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GBP4Q96PP9 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GBP4Q96PP9 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GBP4Q96PP9 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GBP4Q96PP9 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GBP4Q96PP9 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GBP4Q96PP9 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GBP4Q96PP9 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GBP4Q96PP9 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GBP4Q96PP9 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GBP4Q96PP9 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GBP4Q96PP9 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms