Protein–RNA interactions for Protein: Q96MN9

ZNF488, Zinc finger protein 488, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF488Q96MN9 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF488Q96MN9 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF488Q96MN9 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF488Q96MN9 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF488Q96MN9 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF488Q96MN9 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF488Q96MN9 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF488Q96MN9 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF488Q96MN9 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF488Q96MN9 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF488Q96MN9 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF488Q96MN9 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF488Q96MN9 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF488Q96MN9 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF488Q96MN9 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF488Q96MN9 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF488Q96MN9 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF488Q96MN9 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF488Q96MN9 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF488Q96MN9 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNF488Q96MN9 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNF488Q96MN9 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNF488Q96MN9 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNF488Q96MN9 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNF488Q96MN9 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNF488Q96MN9 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNF488Q96MN9 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNF488Q96MN9 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNF488Q96MN9 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNF488Q96MN9 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNF488Q96MN9 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNF488Q96MN9 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF488Q96MN9 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF488Q96MN9 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF488Q96MN9 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF488Q96MN9 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF488Q96MN9 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF488Q96MN9 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF488Q96MN9 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF488Q96MN9 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF488Q96MN9 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF488Q96MN9 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF488Q96MN9 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF488Q96MN9 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF488Q96MN9 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF488Q96MN9 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF488Q96MN9 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF488Q96MN9 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF488Q96MN9 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF488Q96MN9 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF488Q96MN9 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF488Q96MN9 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF488Q96MN9 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF488Q96MN9 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF488Q96MN9 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF488Q96MN9 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF488Q96MN9 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF488Q96MN9 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF488Q96MN9 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF488Q96MN9 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF488Q96MN9 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF488Q96MN9 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF488Q96MN9 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF488Q96MN9 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF488Q96MN9 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF488Q96MN9 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF488Q96MN9 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF488Q96MN9 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF488Q96MN9 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF488Q96MN9 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF488Q96MN9 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF488Q96MN9 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF488Q96MN9 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF488Q96MN9 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF488Q96MN9 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF488Q96MN9 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF488Q96MN9 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF488Q96MN9 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF488Q96MN9 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF488Q96MN9 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF488Q96MN9 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF488Q96MN9 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF488Q96MN9 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF488Q96MN9 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF488Q96MN9 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF488Q96MN9 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF488Q96MN9 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF488Q96MN9 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF488Q96MN9 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF488Q96MN9 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF488Q96MN9 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF488Q96MN9 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF488Q96MN9 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF488Q96MN9 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF488Q96MN9 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF488Q96MN9 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF488Q96MN9 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF488Q96MN9 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF488Q96MN9 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF488Q96MN9 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms