Protein–RNA interactions for Protein: Q96JY6

PDLIM2, PDZ and LIM domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM2Q96JY6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDLIM2Q96JY6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDLIM2Q96JY6 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDLIM2Q96JY6 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PDLIM2Q96JY6 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDLIM2Q96JY6 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDLIM2Q96JY6 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDLIM2Q96JY6 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDLIM2Q96JY6 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDLIM2Q96JY6 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDLIM2Q96JY6 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDLIM2Q96JY6 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDLIM2Q96JY6 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDLIM2Q96JY6 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDLIM2Q96JY6 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDLIM2Q96JY6 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDLIM2Q96JY6 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDLIM2Q96JY6 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDLIM2Q96JY6 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDLIM2Q96JY6 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDLIM2Q96JY6 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDLIM2Q96JY6 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDLIM2Q96JY6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PDLIM2Q96JY6 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PDLIM2Q96JY6 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDLIM2Q96JY6 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDLIM2Q96JY6 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDLIM2Q96JY6 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDLIM2Q96JY6 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDLIM2Q96JY6 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDLIM2Q96JY6 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDLIM2Q96JY6 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDLIM2Q96JY6 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDLIM2Q96JY6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PDLIM2Q96JY6 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDLIM2Q96JY6 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDLIM2Q96JY6 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDLIM2Q96JY6 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDLIM2Q96JY6 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDLIM2Q96JY6 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDLIM2Q96JY6 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDLIM2Q96JY6 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDLIM2Q96JY6 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDLIM2Q96JY6 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDLIM2Q96JY6 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDLIM2Q96JY6 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDLIM2Q96JY6 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDLIM2Q96JY6 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDLIM2Q96JY6 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDLIM2Q96JY6 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDLIM2Q96JY6 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDLIM2Q96JY6 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDLIM2Q96JY6 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDLIM2Q96JY6 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDLIM2Q96JY6 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDLIM2Q96JY6 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDLIM2Q96JY6 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDLIM2Q96JY6 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDLIM2Q96JY6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDLIM2Q96JY6 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDLIM2Q96JY6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDLIM2Q96JY6 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PDLIM2Q96JY6 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDLIM2Q96JY6 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDLIM2Q96JY6 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDLIM2Q96JY6 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDLIM2Q96JY6 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDLIM2Q96JY6 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDLIM2Q96JY6 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDLIM2Q96JY6 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDLIM2Q96JY6 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDLIM2Q96JY6 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDLIM2Q96JY6 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDLIM2Q96JY6 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PDLIM2Q96JY6 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PDLIM2Q96JY6 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDLIM2Q96JY6 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDLIM2Q96JY6 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDLIM2Q96JY6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDLIM2Q96JY6 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PDLIM2Q96JY6 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDLIM2Q96JY6 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDLIM2Q96JY6 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDLIM2Q96JY6 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDLIM2Q96JY6 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDLIM2Q96JY6 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDLIM2Q96JY6 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDLIM2Q96JY6 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDLIM2Q96JY6 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDLIM2Q96JY6 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDLIM2Q96JY6 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDLIM2Q96JY6 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDLIM2Q96JY6 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDLIM2Q96JY6 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDLIM2Q96JY6 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDLIM2Q96JY6 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDLIM2Q96JY6 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDLIM2Q96JY6 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDLIM2Q96JY6 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDLIM2Q96JY6 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms