Protein–RNA interactions for Protein: Q96EL3

MRPL53, 39S ribosomal protein L53, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL53Q96EL3 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MRPL53Q96EL3 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MRPL53Q96EL3 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
MRPL53Q96EL3 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MRPL53Q96EL3 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MRPL53Q96EL3 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MRPL53Q96EL3 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MRPL53Q96EL3 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MRPL53Q96EL3 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MRPL53Q96EL3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MRPL53Q96EL3 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
MRPL53Q96EL3 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
MRPL53Q96EL3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
MRPL53Q96EL3 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MRPL53Q96EL3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MRPL53Q96EL3 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MRPL53Q96EL3 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MRPL53Q96EL3 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MRPL53Q96EL3 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MRPL53Q96EL3 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MRPL53Q96EL3 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MRPL53Q96EL3 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MRPL53Q96EL3 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MRPL53Q96EL3 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MRPL53Q96EL3 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MRPL53Q96EL3 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MRPL53Q96EL3 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MRPL53Q96EL3 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MRPL53Q96EL3 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MRPL53Q96EL3 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MRPL53Q96EL3 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MRPL53Q96EL3 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MRPL53Q96EL3 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MRPL53Q96EL3 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MRPL53Q96EL3 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MRPL53Q96EL3 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MRPL53Q96EL3 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MRPL53Q96EL3 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MRPL53Q96EL3 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MRPL53Q96EL3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MRPL53Q96EL3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MRPL53Q96EL3 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MRPL53Q96EL3 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MRPL53Q96EL3 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MRPL53Q96EL3 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MRPL53Q96EL3 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MRPL53Q96EL3 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MRPL53Q96EL3 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MRPL53Q96EL3 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MRPL53Q96EL3 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MRPL53Q96EL3 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MRPL53Q96EL3 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MRPL53Q96EL3 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MRPL53Q96EL3 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
MRPL53Q96EL3 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MRPL53Q96EL3 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MRPL53Q96EL3 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MRPL53Q96EL3 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
MRPL53Q96EL3 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MRPL53Q96EL3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MRPL53Q96EL3 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MRPL53Q96EL3 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MRPL53Q96EL3 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MRPL53Q96EL3 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MRPL53Q96EL3 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MRPL53Q96EL3 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MRPL53Q96EL3 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MRPL53Q96EL3 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MRPL53Q96EL3 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MRPL53Q96EL3 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MRPL53Q96EL3 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MRPL53Q96EL3 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MRPL53Q96EL3 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MRPL53Q96EL3 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MRPL53Q96EL3 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MRPL53Q96EL3 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MRPL53Q96EL3 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MRPL53Q96EL3 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MRPL53Q96EL3 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
MRPL53Q96EL3 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MRPL53Q96EL3 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MRPL53Q96EL3 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MRPL53Q96EL3 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MRPL53Q96EL3 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
MRPL53Q96EL3 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MRPL53Q96EL3 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MRPL53Q96EL3 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MRPL53Q96EL3 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MRPL53Q96EL3 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MRPL53Q96EL3 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MRPL53Q96EL3 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MRPL53Q96EL3 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MRPL53Q96EL3 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MRPL53Q96EL3 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MRPL53Q96EL3 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MRPL53Q96EL3 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MRPL53Q96EL3 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MRPL53Q96EL3 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MRPL53Q96EL3 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MRPL53Q96EL3 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms