Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAU0

NKX2-3, Homeobox protein Nkx-2.3, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-3Q8TAU0 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NKX2-3Q8TAU0 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NKX2-3Q8TAU0 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NKX2-3Q8TAU0 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NKX2-3Q8TAU0 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NKX2-3Q8TAU0 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NKX2-3Q8TAU0 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NKX2-3Q8TAU0 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NKX2-3Q8TAU0 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NKX2-3Q8TAU0 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NKX2-3Q8TAU0 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NKX2-3Q8TAU0 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NKX2-3Q8TAU0 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NKX2-3Q8TAU0 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NKX2-3Q8TAU0 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NKX2-3Q8TAU0 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NKX2-3Q8TAU0 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NKX2-3Q8TAU0 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NKX2-3Q8TAU0 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NKX2-3Q8TAU0 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NKX2-3Q8TAU0 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NKX2-3Q8TAU0 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NKX2-3Q8TAU0 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NKX2-3Q8TAU0 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NKX2-3Q8TAU0 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NKX2-3Q8TAU0 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NKX2-3Q8TAU0 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NKX2-3Q8TAU0 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NKX2-3Q8TAU0 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NKX2-3Q8TAU0 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NKX2-3Q8TAU0 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NKX2-3Q8TAU0 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NKX2-3Q8TAU0 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NKX2-3Q8TAU0 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NKX2-3Q8TAU0 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NKX2-3Q8TAU0 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NKX2-3Q8TAU0 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NKX2-3Q8TAU0 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NKX2-3Q8TAU0 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NKX2-3Q8TAU0 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NKX2-3Q8TAU0 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NKX2-3Q8TAU0 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NKX2-3Q8TAU0 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NKX2-3Q8TAU0 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NKX2-3Q8TAU0 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NKX2-3Q8TAU0 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NKX2-3Q8TAU0 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NKX2-3Q8TAU0 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NKX2-3Q8TAU0 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NKX2-3Q8TAU0 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NKX2-3Q8TAU0 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NKX2-3Q8TAU0 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NKX2-3Q8TAU0 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NKX2-3Q8TAU0 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NKX2-3Q8TAU0 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NKX2-3Q8TAU0 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NKX2-3Q8TAU0 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NKX2-3Q8TAU0 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NKX2-3Q8TAU0 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NKX2-3Q8TAU0 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NKX2-3Q8TAU0 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NKX2-3Q8TAU0 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NKX2-3Q8TAU0 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NKX2-3Q8TAU0 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NKX2-3Q8TAU0 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NKX2-3Q8TAU0 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NKX2-3Q8TAU0 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NKX2-3Q8TAU0 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NKX2-3Q8TAU0 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NKX2-3Q8TAU0 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NKX2-3Q8TAU0 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NKX2-3Q8TAU0 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NKX2-3Q8TAU0 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NKX2-3Q8TAU0 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NKX2-3Q8TAU0 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NKX2-3Q8TAU0 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NKX2-3Q8TAU0 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NKX2-3Q8TAU0 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NKX2-3Q8TAU0 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NKX2-3Q8TAU0 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NKX2-3Q8TAU0 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NKX2-3Q8TAU0 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NKX2-3Q8TAU0 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NKX2-3Q8TAU0 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NKX2-3Q8TAU0 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NKX2-3Q8TAU0 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NKX2-3Q8TAU0 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NKX2-3Q8TAU0 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NKX2-3Q8TAU0 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NKX2-3Q8TAU0 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NKX2-3Q8TAU0 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NKX2-3Q8TAU0 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NKX2-3Q8TAU0 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NKX2-3Q8TAU0 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NKX2-3Q8TAU0 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NKX2-3Q8TAU0 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NKX2-3Q8TAU0 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NKX2-3Q8TAU0 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NKX2-3Q8TAU0 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NKX2-3Q8TAU0 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms