Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP7

KLHDC9, Kelch domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC9Q8NEP7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHDC9Q8NEP7 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHDC9Q8NEP7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHDC9Q8NEP7 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHDC9Q8NEP7 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHDC9Q8NEP7 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHDC9Q8NEP7 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHDC9Q8NEP7 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHDC9Q8NEP7 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHDC9Q8NEP7 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHDC9Q8NEP7 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHDC9Q8NEP7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHDC9Q8NEP7 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHDC9Q8NEP7 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHDC9Q8NEP7 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHDC9Q8NEP7 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHDC9Q8NEP7 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHDC9Q8NEP7 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHDC9Q8NEP7 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHDC9Q8NEP7 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHDC9Q8NEP7 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHDC9Q8NEP7 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHDC9Q8NEP7 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHDC9Q8NEP7 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHDC9Q8NEP7 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHDC9Q8NEP7 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLHDC9Q8NEP7 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLHDC9Q8NEP7 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLHDC9Q8NEP7 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLHDC9Q8NEP7 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLHDC9Q8NEP7 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLHDC9Q8NEP7 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLHDC9Q8NEP7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLHDC9Q8NEP7 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLHDC9Q8NEP7 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLHDC9Q8NEP7 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
KLHDC9Q8NEP7 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHDC9Q8NEP7 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHDC9Q8NEP7 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHDC9Q8NEP7 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHDC9Q8NEP7 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHDC9Q8NEP7 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHDC9Q8NEP7 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHDC9Q8NEP7 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHDC9Q8NEP7 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHDC9Q8NEP7 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHDC9Q8NEP7 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHDC9Q8NEP7 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHDC9Q8NEP7 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHDC9Q8NEP7 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHDC9Q8NEP7 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHDC9Q8NEP7 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHDC9Q8NEP7 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHDC9Q8NEP7 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHDC9Q8NEP7 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHDC9Q8NEP7 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHDC9Q8NEP7 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHDC9Q8NEP7 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHDC9Q8NEP7 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHDC9Q8NEP7 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHDC9Q8NEP7 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHDC9Q8NEP7 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHDC9Q8NEP7 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHDC9Q8NEP7 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHDC9Q8NEP7 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHDC9Q8NEP7 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHDC9Q8NEP7 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHDC9Q8NEP7 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHDC9Q8NEP7 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHDC9Q8NEP7 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHDC9Q8NEP7 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHDC9Q8NEP7 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHDC9Q8NEP7 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHDC9Q8NEP7 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHDC9Q8NEP7 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHDC9Q8NEP7 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHDC9Q8NEP7 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHDC9Q8NEP7 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHDC9Q8NEP7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHDC9Q8NEP7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHDC9Q8NEP7 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHDC9Q8NEP7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHDC9Q8NEP7 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHDC9Q8NEP7 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHDC9Q8NEP7 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHDC9Q8NEP7 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHDC9Q8NEP7 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHDC9Q8NEP7 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHDC9Q8NEP7 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHDC9Q8NEP7 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHDC9Q8NEP7 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHDC9Q8NEP7 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHDC9Q8NEP7 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHDC9Q8NEP7 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHDC9Q8NEP7 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHDC9Q8NEP7 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHDC9Q8NEP7 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHDC9Q8NEP7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHDC9Q8NEP7 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHDC9Q8NEP7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms