Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW8

TTC21A, Tetratricopeptide repeat protein 21A, humanhuman

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Length 1,320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC21AQ8NDW8 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
TTC21AQ8NDW8 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TTC21AQ8NDW8 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TTC21AQ8NDW8 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TTC21AQ8NDW8 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TTC21AQ8NDW8 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
TTC21AQ8NDW8 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TTC21AQ8NDW8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TTC21AQ8NDW8 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TTC21AQ8NDW8 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TTC21AQ8NDW8 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TTC21AQ8NDW8 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TTC21AQ8NDW8 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TTC21AQ8NDW8 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
TTC21AQ8NDW8 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TTC21AQ8NDW8 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TTC21AQ8NDW8 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
TTC21AQ8NDW8 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TTC21AQ8NDW8 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TTC21AQ8NDW8 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TTC21AQ8NDW8 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TTC21AQ8NDW8 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TTC21AQ8NDW8 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TTC21AQ8NDW8 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TTC21AQ8NDW8 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TTC21AQ8NDW8 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TTC21AQ8NDW8 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TTC21AQ8NDW8 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TTC21AQ8NDW8 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TTC21AQ8NDW8 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TTC21AQ8NDW8 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TTC21AQ8NDW8 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TTC21AQ8NDW8 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TTC21AQ8NDW8 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TTC21AQ8NDW8 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TTC21AQ8NDW8 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TTC21AQ8NDW8 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
TTC21AQ8NDW8 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TTC21AQ8NDW8 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TTC21AQ8NDW8 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TTC21AQ8NDW8 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TTC21AQ8NDW8 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TTC21AQ8NDW8 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TTC21AQ8NDW8 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TTC21AQ8NDW8 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TTC21AQ8NDW8 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TTC21AQ8NDW8 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TTC21AQ8NDW8 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TTC21AQ8NDW8 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TTC21AQ8NDW8 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TTC21AQ8NDW8 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TTC21AQ8NDW8 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TTC21AQ8NDW8 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TTC21AQ8NDW8 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TTC21AQ8NDW8 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TTC21AQ8NDW8 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TTC21AQ8NDW8 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TTC21AQ8NDW8 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
TTC21AQ8NDW8 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TTC21AQ8NDW8 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
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TTC21AQ8NDW8 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TTC21AQ8NDW8 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TTC21AQ8NDW8 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TTC21AQ8NDW8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TTC21AQ8NDW8 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TTC21AQ8NDW8 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
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TTC21AQ8NDW8 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TTC21AQ8NDW8 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TTC21AQ8NDW8 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TTC21AQ8NDW8 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TTC21AQ8NDW8 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TTC21AQ8NDW8 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
TTC21AQ8NDW8 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TTC21AQ8NDW8 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TTC21AQ8NDW8 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TTC21AQ8NDW8 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TTC21AQ8NDW8 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TTC21AQ8NDW8 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
TTC21AQ8NDW8 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
TTC21AQ8NDW8 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TTC21AQ8NDW8 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
TTC21AQ8NDW8 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TTC21AQ8NDW8 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
TTC21AQ8NDW8 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TTC21AQ8NDW8 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
TTC21AQ8NDW8 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
TTC21AQ8NDW8 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TTC21AQ8NDW8 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TTC21AQ8NDW8 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TTC21AQ8NDW8 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TTC21AQ8NDW8 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TTC21AQ8NDW8 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TTC21AQ8NDW8 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
TTC21AQ8NDW8 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TTC21AQ8NDW8 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TTC21AQ8NDW8 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TTC21AQ8NDW8 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TTC21AQ8NDW8 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
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