Protein–RNA interactions for Protein: Q8N300

SVBP, Small vasohibin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVBPQ8N300 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SVBPQ8N300 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SVBPQ8N300 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SVBPQ8N300 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SVBPQ8N300 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SVBPQ8N300 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SVBPQ8N300 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SVBPQ8N300 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SVBPQ8N300 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SVBPQ8N300 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SVBPQ8N300 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SVBPQ8N300 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SVBPQ8N300 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SVBPQ8N300 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SVBPQ8N300 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SVBPQ8N300 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SVBPQ8N300 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SVBPQ8N300 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SVBPQ8N300 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SVBPQ8N300 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SVBPQ8N300 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SVBPQ8N300 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SVBPQ8N300 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SVBPQ8N300 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SVBPQ8N300 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SVBPQ8N300 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms