Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7A3

CTU1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU1Q7Z7A3 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTU1Q7Z7A3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTU1Q7Z7A3 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTU1Q7Z7A3 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTU1Q7Z7A3 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTU1Q7Z7A3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTU1Q7Z7A3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTU1Q7Z7A3 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTU1Q7Z7A3 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTU1Q7Z7A3 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTU1Q7Z7A3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTU1Q7Z7A3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTU1Q7Z7A3 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTU1Q7Z7A3 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTU1Q7Z7A3 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTU1Q7Z7A3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTU1Q7Z7A3 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTU1Q7Z7A3 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTU1Q7Z7A3 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTU1Q7Z7A3 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTU1Q7Z7A3 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTU1Q7Z7A3 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTU1Q7Z7A3 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTU1Q7Z7A3 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTU1Q7Z7A3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTU1Q7Z7A3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTU1Q7Z7A3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTU1Q7Z7A3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTU1Q7Z7A3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTU1Q7Z7A3 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTU1Q7Z7A3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTU1Q7Z7A3 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTU1Q7Z7A3 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTU1Q7Z7A3 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CTU1Q7Z7A3 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTU1Q7Z7A3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTU1Q7Z7A3 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CTU1Q7Z7A3 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTU1Q7Z7A3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTU1Q7Z7A3 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTU1Q7Z7A3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTU1Q7Z7A3 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTU1Q7Z7A3 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTU1Q7Z7A3 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTU1Q7Z7A3 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTU1Q7Z7A3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTU1Q7Z7A3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTU1Q7Z7A3 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTU1Q7Z7A3 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTU1Q7Z7A3 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTU1Q7Z7A3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTU1Q7Z7A3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTU1Q7Z7A3 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTU1Q7Z7A3 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CTU1Q7Z7A3 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CTU1Q7Z7A3 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTU1Q7Z7A3 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTU1Q7Z7A3 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CTU1Q7Z7A3 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTU1Q7Z7A3 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTU1Q7Z7A3 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTU1Q7Z7A3 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTU1Q7Z7A3 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTU1Q7Z7A3 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTU1Q7Z7A3 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CTU1Q7Z7A3 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTU1Q7Z7A3 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CTU1Q7Z7A3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTU1Q7Z7A3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTU1Q7Z7A3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTU1Q7Z7A3 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CTU1Q7Z7A3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CTU1Q7Z7A3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CTU1Q7Z7A3 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CTU1Q7Z7A3 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CTU1Q7Z7A3 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CTU1Q7Z7A3 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CTU1Q7Z7A3 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTU1Q7Z7A3 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTU1Q7Z7A3 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTU1Q7Z7A3 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTU1Q7Z7A3 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTU1Q7Z7A3 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CTU1Q7Z7A3 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTU1Q7Z7A3 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTU1Q7Z7A3 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTU1Q7Z7A3 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTU1Q7Z7A3 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTU1Q7Z7A3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTU1Q7Z7A3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTU1Q7Z7A3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTU1Q7Z7A3 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTU1Q7Z7A3 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTU1Q7Z7A3 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTU1Q7Z7A3 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTU1Q7Z7A3 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTU1Q7Z7A3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTU1Q7Z7A3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTU1Q7Z7A3 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CTU1Q7Z7A3 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms