Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWZ7

ABRAXAS1, BRCA1-A complex subunit Abraxas 1, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ABRAXAS1Q6UWZ7 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ABRAXAS1Q6UWZ7 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ABRAXAS1Q6UWZ7 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ABRAXAS1Q6UWZ7 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ABRAXAS1Q6UWZ7 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ABRAXAS1Q6UWZ7 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ABRAXAS1Q6UWZ7 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ABRAXAS1Q6UWZ7 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ABRAXAS1Q6UWZ7 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ABRAXAS1Q6UWZ7 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ABRAXAS1Q6UWZ7 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ABRAXAS1Q6UWZ7 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ABRAXAS1Q6UWZ7 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ABRAXAS1Q6UWZ7 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ABRAXAS1Q6UWZ7 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ABRAXAS1Q6UWZ7 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ABRAXAS1Q6UWZ7 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABRAXAS1Q6UWZ7 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABRAXAS1Q6UWZ7 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABRAXAS1Q6UWZ7 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABRAXAS1Q6UWZ7 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABRAXAS1Q6UWZ7 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABRAXAS1Q6UWZ7 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABRAXAS1Q6UWZ7 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABRAXAS1Q6UWZ7 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABRAXAS1Q6UWZ7 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABRAXAS1Q6UWZ7 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABRAXAS1Q6UWZ7 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ABRAXAS1Q6UWZ7 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABRAXAS1Q6UWZ7 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABRAXAS1Q6UWZ7 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABRAXAS1Q6UWZ7 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABRAXAS1Q6UWZ7 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABRAXAS1Q6UWZ7 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ABRAXAS1Q6UWZ7 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ABRAXAS1Q6UWZ7 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ABRAXAS1Q6UWZ7 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ABRAXAS1Q6UWZ7 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ABRAXAS1Q6UWZ7 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ABRAXAS1Q6UWZ7 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ABRAXAS1Q6UWZ7 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ABRAXAS1Q6UWZ7 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ABRAXAS1Q6UWZ7 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ABRAXAS1Q6UWZ7 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ABRAXAS1Q6UWZ7 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ABRAXAS1Q6UWZ7 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ABRAXAS1Q6UWZ7 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ABRAXAS1Q6UWZ7 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ABRAXAS1Q6UWZ7 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ABRAXAS1Q6UWZ7 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ABRAXAS1Q6UWZ7 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ABRAXAS1Q6UWZ7 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ABRAXAS1Q6UWZ7 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ABRAXAS1Q6UWZ7 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ABRAXAS1Q6UWZ7 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ABRAXAS1Q6UWZ7 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ABRAXAS1Q6UWZ7 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ABRAXAS1Q6UWZ7 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ABRAXAS1Q6UWZ7 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ABRAXAS1Q6UWZ7 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ABRAXAS1Q6UWZ7 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ABRAXAS1Q6UWZ7 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ABRAXAS1Q6UWZ7 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ABRAXAS1Q6UWZ7 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ABRAXAS1Q6UWZ7 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ABRAXAS1Q6UWZ7 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ABRAXAS1Q6UWZ7 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ABRAXAS1Q6UWZ7 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ABRAXAS1Q6UWZ7 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ABRAXAS1Q6UWZ7 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ABRAXAS1Q6UWZ7 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ABRAXAS1Q6UWZ7 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ABRAXAS1Q6UWZ7 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ABRAXAS1Q6UWZ7 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ABRAXAS1Q6UWZ7 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ABRAXAS1Q6UWZ7 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ABRAXAS1Q6UWZ7 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ABRAXAS1Q6UWZ7 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ABRAXAS1Q6UWZ7 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ABRAXAS1Q6UWZ7 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ABRAXAS1Q6UWZ7 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ABRAXAS1Q6UWZ7 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ABRAXAS1Q6UWZ7 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ABRAXAS1Q6UWZ7 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms