Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q788

APOA5, Apolipoprotein A-V, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA5Q6Q788 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
APOA5Q6Q788 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
APOA5Q6Q788 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
APOA5Q6Q788 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
APOA5Q6Q788 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
APOA5Q6Q788 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
APOA5Q6Q788 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
APOA5Q6Q788 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
APOA5Q6Q788 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
APOA5Q6Q788 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
APOA5Q6Q788 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
APOA5Q6Q788 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
APOA5Q6Q788 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
APOA5Q6Q788 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
APOA5Q6Q788 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
APOA5Q6Q788 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
APOA5Q6Q788 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
APOA5Q6Q788 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
APOA5Q6Q788 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
APOA5Q6Q788 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
APOA5Q6Q788 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
APOA5Q6Q788 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
APOA5Q6Q788 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
APOA5Q6Q788 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
APOA5Q6Q788 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
APOA5Q6Q788 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
APOA5Q6Q788 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
APOA5Q6Q788 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
APOA5Q6Q788 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
APOA5Q6Q788 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
APOA5Q6Q788 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
APOA5Q6Q788 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
APOA5Q6Q788 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
APOA5Q6Q788 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
APOA5Q6Q788 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
APOA5Q6Q788 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
APOA5Q6Q788 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
APOA5Q6Q788 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
APOA5Q6Q788 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
APOA5Q6Q788 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
APOA5Q6Q788 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
APOA5Q6Q788 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
APOA5Q6Q788 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
APOA5Q6Q788 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
APOA5Q6Q788 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
APOA5Q6Q788 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
APOA5Q6Q788 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
APOA5Q6Q788 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
APOA5Q6Q788 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
APOA5Q6Q788 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
APOA5Q6Q788 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
APOA5Q6Q788 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
APOA5Q6Q788 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
APOA5Q6Q788 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
APOA5Q6Q788 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
APOA5Q6Q788 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
APOA5Q6Q788 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
APOA5Q6Q788 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
APOA5Q6Q788 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
APOA5Q6Q788 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
APOA5Q6Q788 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
APOA5Q6Q788 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
APOA5Q6Q788 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
APOA5Q6Q788 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
APOA5Q6Q788 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
APOA5Q6Q788 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
APOA5Q6Q788 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
APOA5Q6Q788 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
APOA5Q6Q788 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
APOA5Q6Q788 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
APOA5Q6Q788 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
APOA5Q6Q788 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
APOA5Q6Q788 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
APOA5Q6Q788 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
APOA5Q6Q788 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
APOA5Q6Q788 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
APOA5Q6Q788 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
APOA5Q6Q788 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
APOA5Q6Q788 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
APOA5Q6Q788 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
APOA5Q6Q788 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
APOA5Q6Q788 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
APOA5Q6Q788 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
APOA5Q6Q788 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
APOA5Q6Q788 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
APOA5Q6Q788 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
APOA5Q6Q788 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
APOA5Q6Q788 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
APOA5Q6Q788 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
APOA5Q6Q788 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
APOA5Q6Q788 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
APOA5Q6Q788 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
APOA5Q6Q788 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
APOA5Q6Q788 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
APOA5Q6Q788 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
APOA5Q6Q788 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
APOA5Q6Q788 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
APOA5Q6Q788 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
APOA5Q6Q788 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
APOA5Q6Q788 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms