Protein–RNA interactions for Protein: Q69YN4

VIRMA, Protein virilizer homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIRMAQ69YN4 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
VIRMAQ69YN4 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
VIRMAQ69YN4 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
VIRMAQ69YN4 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
VIRMAQ69YN4 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
VIRMAQ69YN4 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
VIRMAQ69YN4 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
VIRMAQ69YN4 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
VIRMAQ69YN4 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
VIRMAQ69YN4 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
VIRMAQ69YN4 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
VIRMAQ69YN4 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
VIRMAQ69YN4 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
VIRMAQ69YN4 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
VIRMAQ69YN4 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
VIRMAQ69YN4 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
VIRMAQ69YN4 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
VIRMAQ69YN4 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
VIRMAQ69YN4 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
VIRMAQ69YN4 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
VIRMAQ69YN4 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
VIRMAQ69YN4 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
VIRMAQ69YN4 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
VIRMAQ69YN4 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
VIRMAQ69YN4 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
VIRMAQ69YN4 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
VIRMAQ69YN4 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
VIRMAQ69YN4 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
VIRMAQ69YN4 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
VIRMAQ69YN4 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
VIRMAQ69YN4 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
VIRMAQ69YN4 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
VIRMAQ69YN4 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
VIRMAQ69YN4 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
VIRMAQ69YN4 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
VIRMAQ69YN4 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
VIRMAQ69YN4 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
VIRMAQ69YN4 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
VIRMAQ69YN4 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
VIRMAQ69YN4 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
VIRMAQ69YN4 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
VIRMAQ69YN4 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
VIRMAQ69YN4 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
VIRMAQ69YN4 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
VIRMAQ69YN4 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
VIRMAQ69YN4 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
VIRMAQ69YN4 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
VIRMAQ69YN4 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
VIRMAQ69YN4 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
VIRMAQ69YN4 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
VIRMAQ69YN4 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
VIRMAQ69YN4 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
VIRMAQ69YN4 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
VIRMAQ69YN4 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
VIRMAQ69YN4 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
VIRMAQ69YN4 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
VIRMAQ69YN4 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
VIRMAQ69YN4 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
VIRMAQ69YN4 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
VIRMAQ69YN4 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
VIRMAQ69YN4 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
VIRMAQ69YN4 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
VIRMAQ69YN4 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
VIRMAQ69YN4 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
VIRMAQ69YN4 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
VIRMAQ69YN4 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
VIRMAQ69YN4 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
VIRMAQ69YN4 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
VIRMAQ69YN4 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
VIRMAQ69YN4 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
VIRMAQ69YN4 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
VIRMAQ69YN4 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
VIRMAQ69YN4 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
VIRMAQ69YN4 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.88
VIRMAQ69YN4 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
VIRMAQ69YN4 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
VIRMAQ69YN4 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
VIRMAQ69YN4 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
VIRMAQ69YN4 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
VIRMAQ69YN4 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
VIRMAQ69YN4 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
VIRMAQ69YN4 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
VIRMAQ69YN4 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
VIRMAQ69YN4 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
VIRMAQ69YN4 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
VIRMAQ69YN4 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
VIRMAQ69YN4 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
VIRMAQ69YN4 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
VIRMAQ69YN4 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
VIRMAQ69YN4 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
VIRMAQ69YN4 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
VIRMAQ69YN4 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
VIRMAQ69YN4 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
VIRMAQ69YN4 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
VIRMAQ69YN4 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
VIRMAQ69YN4 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
VIRMAQ69YN4 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
VIRMAQ69YN4 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
VIRMAQ69YN4 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
VIRMAQ69YN4 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms