Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSR9

SPANXN1, Sperm protein associated with the nucleus on the X chromosome N1, humanhuman

Predictions only

Length 72 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPANXN1Q5VSR9 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPANXN1Q5VSR9 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SPANXN1Q5VSR9 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPANXN1Q5VSR9 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPANXN1Q5VSR9 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPANXN1Q5VSR9 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPANXN1Q5VSR9 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPANXN1Q5VSR9 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPANXN1Q5VSR9 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPANXN1Q5VSR9 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPANXN1Q5VSR9 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPANXN1Q5VSR9 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPANXN1Q5VSR9 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPANXN1Q5VSR9 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPANXN1Q5VSR9 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPANXN1Q5VSR9 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SPANXN1Q5VSR9 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPANXN1Q5VSR9 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPANXN1Q5VSR9 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPANXN1Q5VSR9 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPANXN1Q5VSR9 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPANXN1Q5VSR9 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPANXN1Q5VSR9 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPANXN1Q5VSR9 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPANXN1Q5VSR9 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPANXN1Q5VSR9 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPANXN1Q5VSR9 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPANXN1Q5VSR9 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPANXN1Q5VSR9 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPANXN1Q5VSR9 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPANXN1Q5VSR9 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPANXN1Q5VSR9 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SPANXN1Q5VSR9 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPANXN1Q5VSR9 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPANXN1Q5VSR9 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPANXN1Q5VSR9 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPANXN1Q5VSR9 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPANXN1Q5VSR9 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPANXN1Q5VSR9 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPANXN1Q5VSR9 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPANXN1Q5VSR9 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SPANXN1Q5VSR9 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPANXN1Q5VSR9 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPANXN1Q5VSR9 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPANXN1Q5VSR9 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPANXN1Q5VSR9 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPANXN1Q5VSR9 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPANXN1Q5VSR9 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPANXN1Q5VSR9 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPANXN1Q5VSR9 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPANXN1Q5VSR9 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPANXN1Q5VSR9 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPANXN1Q5VSR9 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPANXN1Q5VSR9 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPANXN1Q5VSR9 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPANXN1Q5VSR9 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPANXN1Q5VSR9 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPANXN1Q5VSR9 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPANXN1Q5VSR9 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPANXN1Q5VSR9 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPANXN1Q5VSR9 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPANXN1Q5VSR9 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPANXN1Q5VSR9 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPANXN1Q5VSR9 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPANXN1Q5VSR9 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPANXN1Q5VSR9 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPANXN1Q5VSR9 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPANXN1Q5VSR9 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPANXN1Q5VSR9 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPANXN1Q5VSR9 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPANXN1Q5VSR9 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPANXN1Q5VSR9 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPANXN1Q5VSR9 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPANXN1Q5VSR9 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPANXN1Q5VSR9 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPANXN1Q5VSR9 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPANXN1Q5VSR9 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPANXN1Q5VSR9 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPANXN1Q5VSR9 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPANXN1Q5VSR9 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SPANXN1Q5VSR9 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SPANXN1Q5VSR9 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SPANXN1Q5VSR9 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SPANXN1Q5VSR9 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SPANXN1Q5VSR9 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SPANXN1Q5VSR9 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPANXN1Q5VSR9 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPANXN1Q5VSR9 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPANXN1Q5VSR9 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPANXN1Q5VSR9 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPANXN1Q5VSR9 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SPANXN1Q5VSR9 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SPANXN1Q5VSR9 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SPANXN1Q5VSR9 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPANXN1Q5VSR9 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPANXN1Q5VSR9 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPANXN1Q5VSR9 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SPANXN1Q5VSR9 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPANXN1Q5VSR9 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPANXN1Q5VSR9 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms