Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5S1

CCDC183, Coiled-coil domain-containing protein 183, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC183Q5T5S1 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC183Q5T5S1 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC183Q5T5S1 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC183Q5T5S1 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC183Q5T5S1 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC183Q5T5S1 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC183Q5T5S1 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC183Q5T5S1 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC183Q5T5S1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC183Q5T5S1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC183Q5T5S1 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC183Q5T5S1 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC183Q5T5S1 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC183Q5T5S1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC183Q5T5S1 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC183Q5T5S1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC183Q5T5S1 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC183Q5T5S1 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC183Q5T5S1 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC183Q5T5S1 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC183Q5T5S1 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC183Q5T5S1 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC183Q5T5S1 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC183Q5T5S1 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC183Q5T5S1 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC183Q5T5S1 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC183Q5T5S1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC183Q5T5S1 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC183Q5T5S1 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC183Q5T5S1 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC183Q5T5S1 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC183Q5T5S1 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC183Q5T5S1 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC183Q5T5S1 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC183Q5T5S1 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC183Q5T5S1 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC183Q5T5S1 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC183Q5T5S1 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC183Q5T5S1 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC183Q5T5S1 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC183Q5T5S1 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC183Q5T5S1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC183Q5T5S1 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC183Q5T5S1 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC183Q5T5S1 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC183Q5T5S1 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC183Q5T5S1 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC183Q5T5S1 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC183Q5T5S1 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC183Q5T5S1 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC183Q5T5S1 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC183Q5T5S1 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC183Q5T5S1 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC183Q5T5S1 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC183Q5T5S1 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC183Q5T5S1 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC183Q5T5S1 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC183Q5T5S1 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC183Q5T5S1 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC183Q5T5S1 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC183Q5T5S1 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC183Q5T5S1 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC183Q5T5S1 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC183Q5T5S1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC183Q5T5S1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC183Q5T5S1 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC183Q5T5S1 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC183Q5T5S1 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC183Q5T5S1 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC183Q5T5S1 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC183Q5T5S1 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC183Q5T5S1 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC183Q5T5S1 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC183Q5T5S1 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC183Q5T5S1 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC183Q5T5S1 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC183Q5T5S1 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC183Q5T5S1 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC183Q5T5S1 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC183Q5T5S1 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC183Q5T5S1 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC183Q5T5S1 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC183Q5T5S1 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC183Q5T5S1 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC183Q5T5S1 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC183Q5T5S1 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC183Q5T5S1 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC183Q5T5S1 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC183Q5T5S1 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC183Q5T5S1 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC183Q5T5S1 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC183Q5T5S1 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC183Q5T5S1 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC183Q5T5S1 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC183Q5T5S1 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC183Q5T5S1 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC183Q5T5S1 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC183Q5T5S1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC183Q5T5S1 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC183Q5T5S1 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms