Protein–RNA interactions for Protein: Q16623

STX1A, Syntaxin-1A, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX1AQ16623 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
STX1AQ16623 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
STX1AQ16623 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
STX1AQ16623 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
STX1AQ16623 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
STX1AQ16623 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
STX1AQ16623 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
STX1AQ16623 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
STX1AQ16623 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
STX1AQ16623 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
STX1AQ16623 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
STX1AQ16623 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
STX1AQ16623 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
STX1AQ16623 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
STX1AQ16623 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
STX1AQ16623 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
STX1AQ16623 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
STX1AQ16623 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
STX1AQ16623 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
STX1AQ16623 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
STX1AQ16623 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
STX1AQ16623 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
STX1AQ16623 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
STX1AQ16623 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
STX1AQ16623 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
STX1AQ16623 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
STX1AQ16623 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
STX1AQ16623 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
STX1AQ16623 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
STX1AQ16623 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
STX1AQ16623 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
STX1AQ16623 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
STX1AQ16623 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
STX1AQ16623 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
STX1AQ16623 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
STX1AQ16623 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
STX1AQ16623 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
STX1AQ16623 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
STX1AQ16623 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
STX1AQ16623 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
STX1AQ16623 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
STX1AQ16623 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
STX1AQ16623 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
STX1AQ16623 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
STX1AQ16623 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
STX1AQ16623 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
STX1AQ16623 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
STX1AQ16623 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
STX1AQ16623 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
STX1AQ16623 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
STX1AQ16623 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
STX1AQ16623 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
STX1AQ16623 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
STX1AQ16623 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
STX1AQ16623 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
STX1AQ16623 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
STX1AQ16623 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
STX1AQ16623 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
STX1AQ16623 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
STX1AQ16623 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
STX1AQ16623 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
STX1AQ16623 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
STX1AQ16623 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
STX1AQ16623 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
STX1AQ16623 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
STX1AQ16623 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
STX1AQ16623 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
STX1AQ16623 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
STX1AQ16623 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
STX1AQ16623 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
STX1AQ16623 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
STX1AQ16623 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
STX1AQ16623 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
STX1AQ16623 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
STX1AQ16623 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
STX1AQ16623 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
STX1AQ16623 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
STX1AQ16623 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
STX1AQ16623 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
STX1AQ16623 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
STX1AQ16623 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
STX1AQ16623 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
STX1AQ16623 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
STX1AQ16623 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
STX1AQ16623 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
STX1AQ16623 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
STX1AQ16623 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
STX1AQ16623 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
STX1AQ16623 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
STX1AQ16623 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
STX1AQ16623 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
STX1AQ16623 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
STX1AQ16623 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
STX1AQ16623 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
STX1AQ16623 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
STX1AQ16623 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
STX1AQ16623 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
STX1AQ16623 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
STX1AQ16623 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
STX1AQ16623 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
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