Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
USF2Q15853 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
USF2Q15853 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
USF2Q15853 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
USF2Q15853 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
USF2Q15853 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
USF2Q15853 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
USF2Q15853 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
USF2Q15853 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
USF2Q15853 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
USF2Q15853 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
USF2Q15853 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
USF2Q15853 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
USF2Q15853 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
USF2Q15853 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
USF2Q15853 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
USF2Q15853 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
USF2Q15853 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
USF2Q15853 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
USF2Q15853 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
USF2Q15853 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
USF2Q15853 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
USF2Q15853 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
USF2Q15853 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
USF2Q15853 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
USF2Q15853 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
USF2Q15853 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
USF2Q15853 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
USF2Q15853 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
USF2Q15853 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
USF2Q15853 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
USF2Q15853 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
USF2Q15853 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
USF2Q15853 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
USF2Q15853 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
USF2Q15853 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
USF2Q15853 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
USF2Q15853 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
USF2Q15853 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
USF2Q15853 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
USF2Q15853 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
USF2Q15853 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
USF2Q15853 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
USF2Q15853 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
USF2Q15853 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
USF2Q15853 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
USF2Q15853 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
USF2Q15853 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
USF2Q15853 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
USF2Q15853 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
USF2Q15853 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
USF2Q15853 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
USF2Q15853 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
USF2Q15853 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
USF2Q15853 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
USF2Q15853 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
USF2Q15853 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
USF2Q15853 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
USF2Q15853 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
USF2Q15853 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
USF2Q15853 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
USF2Q15853 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
USF2Q15853 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
USF2Q15853 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
USF2Q15853 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
USF2Q15853 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
USF2Q15853 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
USF2Q15853 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
USF2Q15853 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
USF2Q15853 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
USF2Q15853 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
USF2Q15853 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
USF2Q15853 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
USF2Q15853 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
USF2Q15853 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
USF2Q15853 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
USF2Q15853 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
USF2Q15853 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
USF2Q15853 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
USF2Q15853 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
USF2Q15853 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
USF2Q15853 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
USF2Q15853 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
USF2Q15853 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
USF2Q15853 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
USF2Q15853 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
USF2Q15853 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
USF2Q15853 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
USF2Q15853 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USF2Q15853 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USF2Q15853 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USF2Q15853 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USF2Q15853 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USF2Q15853 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USF2Q15853 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USF2Q15853 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USF2Q15853 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USF2Q15853 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USF2Q15853 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USF2Q15853 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms