Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HTR4Q13639 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HTR4Q13639 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HTR4Q13639 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HTR4Q13639 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HTR4Q13639 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HTR4Q13639 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HTR4Q13639 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HTR4Q13639 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HTR4Q13639 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HTR4Q13639 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HTR4Q13639 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HTR4Q13639 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HTR4Q13639 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HTR4Q13639 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
HTR4Q13639 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HTR4Q13639 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HTR4Q13639 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HTR4Q13639 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HTR4Q13639 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HTR4Q13639 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HTR4Q13639 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HTR4Q13639 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HTR4Q13639 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HTR4Q13639 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HTR4Q13639 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HTR4Q13639 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HTR4Q13639 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HTR4Q13639 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HTR4Q13639 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HTR4Q13639 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HTR4Q13639 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HTR4Q13639 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HTR4Q13639 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HTR4Q13639 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HTR4Q13639 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HTR4Q13639 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HTR4Q13639 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HTR4Q13639 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HTR4Q13639 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HTR4Q13639 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HTR4Q13639 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HTR4Q13639 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HTR4Q13639 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HTR4Q13639 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HTR4Q13639 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HTR4Q13639 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HTR4Q13639 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
HTR4Q13639 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HTR4Q13639 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HTR4Q13639 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HTR4Q13639 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HTR4Q13639 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HTR4Q13639 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
HTR4Q13639 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HTR4Q13639 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HTR4Q13639 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HTR4Q13639 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HTR4Q13639 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
HTR4Q13639 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HTR4Q13639 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HTR4Q13639 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HTR4Q13639 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HTR4Q13639 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HTR4Q13639 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HTR4Q13639 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
HTR4Q13639 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
HTR4Q13639 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HTR4Q13639 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HTR4Q13639 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HTR4Q13639 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
HTR4Q13639 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
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HTR4Q13639 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
HTR4Q13639 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HTR4Q13639 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
HTR4Q13639 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HTR4Q13639 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HTR4Q13639 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HTR4Q13639 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
HTR4Q13639 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HTR4Q13639 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HTR4Q13639 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HTR4Q13639 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HTR4Q13639 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HTR4Q13639 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HTR4Q13639 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HTR4Q13639 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HTR4Q13639 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HTR4Q13639 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HTR4Q13639 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HTR4Q13639 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HTR4Q13639 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
HTR4Q13639 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HTR4Q13639 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HTR4Q13639 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HTR4Q13639 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HTR4Q13639 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HTR4Q13639 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
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